Whole Genome Approach to the Molecular Genetics of Schizophrenia.
Prosjekt
- Prosjektnummer
- 2007084
- Ansvarlig person
- Srdjan Djurovic
- Institusjon
- Oslo universitetssykehus HF
- Prosjektkategori
- Forskningsprosjekt
- Helsekategori
- Mental Health
- Forskningsaktivitet
- 2. Aetiology
Rapporter
Etiologien til schizofreni er foreløpig ukjent. Genetiske faktorer er vist å spille en viktig rolle i sykdomsbildet, men de underliggende molekylære mekanismene er fortsatt ukjente.Genotyping av hudretusener av enkle nukleære polymorfismer per individ har til nå vært både tidkrevende og dyrt. På grunn av det har steget fra kandidatgenstudier til helgenomstudier vært vanskelig. Nye teknologiske fremskritt og økt kunnskap har nå fremmet ”genome-wide”assosiasjonsstudier (GWA) som økonomisk mulig.
Basert på denne nye teknologien foreslår vi en stor-skala GWA innfallsvinkel for å studere den molekylær genetikken bak psykotiske lidelser. Vi mener at finscreening og genotyping vil gi muligheten for identifisering av nye kandidatgener og gener med endrede uttrykksmønstre som følge av sykdom eller medisinering med antipsykotiske midler.
Vi driver en to-stegs plan hvor markører som viser assosiasjon til psykotiske lidelser i et GWA blir bekreftet ved individuell genotyping. Genotypingen har skjedd ved bruk av Gene Chip Mapping Array teknologi på godt karakteriserte pasienter med schizofreni og kontroller. Dette studiet kan gi oss ny og viktig kunnskap om den genetiske bakgrunnen for schizofreni og den farmakologiske behandlingen av sykdommen. Kunnskapen vil føre til utvikling av praktiske hjelpemidler for individualisert medisinering. Prosjektet er integrert i TOP-studiegruppen og er hovedsakelig basert på data samlet i TOP-studiet.
Doktorgradskandidat Lavinia Athanisiu har fullført sine obligatoriske kurs for Ph.D. graden og arbeider nå intenst med publisering av data. Hun er medforfatter på to publikasjoner i meget anerkjente tidskrifter : (1) " Expanding the range of ZNF804A variants conferring risk of psychosis." Molecular Psychiatry advance online publication 5 January 2010; doi: 10.1038/mp.2009.149 og (2) "Sex-dependent association of common variants of microcephaly genes with brain structure." Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Jan 5;107(1):384-388. Epub 2009 Dec 22. I tillegg er hun førsteforfatter på artikkelen "Gene variants associated with schizophrenia in a Norwegian genomewide study are replicated in a large European cohort." som er under revisjon hos Journal of Psychiatric Research.
Basert på ”genome-wide”assosiasjonsstudier (GWAS) teknologien foreslår vi en stor-skala innfallsvinkel for å studere den molekylær genetikken bak psykotiske lidelserEtiologien til schizofreni er foreløpig ukjent. Genetiske faktorer er vist å spille en viktig rolle i sykdomsbildet, men de underliggende molekylære mekanismene er fortsatt ukjente. Medisinering av pasienter som lider av schizofreni er foreløpig basert på en ”prøv og feil” fremgangsmåte, og klinikere har ingen markører å jobbe etter.
Å genotype hudretusener av enkle nukleære polymorfismer per individ har til nå vært både tidkrevende og dyrt, og derfor har steget fra kandidatgenstudier til helgenomstudier vært vanskelig. Nye teknologiske fremskritt og økt kunnskap har nå fremmet ”genome-wide”assosiasjonsstudier (GWA) som økonomisk mulig.
Basert på denne nye teknologien foreslår vi en stor-skala GWA innfallsvinkel for å studere den molekylær genetikken bak psykotiske lidelser. Vi mener at finscreening og genotyping vil gi muligheten for identifisering av nye kandidatgener og gener med endrede uttryksmønstre som følge av sykdom eller medisinering med antipsykotiske midler.
Vi driver en to-stegs plan, hvor markører som viser assosiasjon til psykotiske lidelser i et GWA blir bekreftet ved individuell genotyping. Genotypingen har skjedd ved bruk av Gene Chip Mapping array teknologi på godt karakteriserte schizofreni passienter og kontroller. Materialet som analyseres nå stammer både fra TOP -studiet og fra et Skandinavisk sammarbeidstudie. Karakteriseringen av pasientene omfatter sykdom, symptommønstre og behandlingshistorie. Denne informasjonen vil muligjøre søk for genetiske markører for medisinrespons og bivirkninger.
Dette studiet kan gi oss ny og viktig kunnskap om den genetiske bakgrunnen for schizofreni og den farmakologiske behandlingen. Kunnskapen vil føre til utvikling av praktiske hjelpemidler for individualisert medisinering. Prosjektet er integrert i TOP-studiegruppen, og er hovedsakelig bassert på data samlet i TOP-studiet.
Basert på denne nye teknologien foreslår vi en GWA innfallsvinkel for å studere den molekylær genetikken bak psykotiske lidelser. Vi mener at finscreening og genotyping vil gi muligheten for identifisering av nye kandidatgener og gener med endrede uttryksmønstre som følge av sykdom eller medisinering med antipsykotiske midler.Etiologien til schizofreni er foreløpig ukjent. Genetiske faktorer er vist å spille en viktig rolle i sykdomsbildet, men de underliggende molekylære mekanismene er fortsatt ukjente. Medisinering av pasienter som lider av schizofreni er foreløpig basert på en ”prøv og feil” fremgangsmåte, og klinikere har ingen markører å jobbe etter.
Å genotype hudretusener av enkle nukleære polymorfismer per individ har til nå vært både tidkrevende og dyrt, og derfor har steget fra kandidatgenstudier til helgenomstudier vært vanskelig. Nye teknologiske fremskritt og økt kunnskap har nå fremmet ”genome-wide”assosiasjonsstudier (GWA) som økonomisk mulig.
Vi foreslår en to-stegs plan, hvor markører som viser assosiasjon til psykotiske lidelser i et GWA blir bekreftet ved individuell genotyping. Genotypingen vil skje ved bruk av Gene Chip Mapping array teknologi på godt karakteriserte schizofreni passienter og kontroller. Materialet som skal analyseres stammer både fra TOP -studiet og fra et Skandinavisk sammarbeidstudie. Karakteriseringen av pasientene omfatter sykdom, symptommønstre og behandlingshistorie. Denne informasjonen vil muligjøre søk for genetiske markører for medisinrespons og bivirkninger.
Dette studiet kan gi oss ny og viktig kunnskap om den genetiske bakgrunnen for schizofreni og den farmakologiske behandlingen. Kunnskapen vil føre til utvikling av praktiske hjelpemidler for individualisert medisinering. Prosjektet er integrert i TOP-studiegruppen, og er hovedsakelig bassert på data samlet i TOP-studiet.
Påbegynt 15/11-07.
Pågående lab.analyser.
eRapport er utarbeidet av Sølvi Lerfald og Reidar Thorstensen, Regionalt kompetansesenter for klinisk forskning, Helse Vest RHF, og videreutvikles av de fire RHF-ene i fellesskap, med støtte fra Helse Vest IKT
Alle henvendelser rettes til eRapport