Sekvensering EM og histologi
Prosjekt
- Prosjektnummer
- 46041400
- Ansvarlig person
- Marite Rygg
- Institusjon
- NTNU, LBK
- Prosjektkategori
- Nytt infrastrukturtiltak
- Helsekategori
- Cancer
- Forskningsaktivitet
- 4. Detection and Diagnosis
Rapporter
Prosjektet omfatter etablering og drift av infrastruktur som benyttes til å fremskaffe forskningsdata til ulike forskningsprosjekter innenfor området elektronmikroskopi (EM), histologi og gensekvensering ved Det medisinske fakultet ved NTNU, og har dermed inngått som støtte for å bygge opp tilbudet i kjernefasiliteten CMIC.
Prosjektet har tilrettelagt for bedring av klinisk diagnostiske metoder, økt kunnskap om mikrostrukturer i vev og tilrettelagt for økt kunnskap om normale og patologiske prosesser i vev, bl.a. bedre typing av ulike kreftformer f.eks. innenfor brystkreft og hjernetumores, noe som på sikt kan bedre prognostiske vurderinger og evt sikre mer individualisert behandling.
Prosjektet omfatter etablering og drift av infrastruktur som benyttes til å fremskaffe forskningsdata til ulike forskningsprosjekter innenfor området elektronmikroskopi (EM), histologi og gensekvensering ved Det medisinske fakultet ved NTNU.EMLab og histologiaktivitetene omfatter etterhvert høyspesialisert metodologi som krever høy kompetanse av teknikere og andre brukere og dyrt utstyr. Begge områder er nå en del av kjernefasiliteten CMIC. Prosjektstøtten i dette prosjektet brukes derfor i kjernefasiliteten for å understøtte infrastrukturen som skal til for å yte god service overfor en rekke brukere i en rekke ulike forskningsprosjekt. Etter knappe to års drift begynner kjernefasiliteten å fungere godt og har bidratt til bedre utnyttelse av de totale ressursene som står til rådighet for de aktuelle aktivitetene, men er enda ikke på langt nær selvfinansierende og er helt avhengig av egenfinansiering/subsidiering fra instituttets side for å kunne yte høykompetent service til en rekke ulike enkeltprosjekt.
Innenfor prosjektmidlene er etablerte serviceavtaler videreført og nødvendig service gjennomført etter planen. Prosjektet finansierer også noe løpende drift innenfor EM, histologi og sekvensering samt delfinansierer en ingeniørstilling ved EM-lab. Prosjektstøtten har vært svært viktig for driften av de aktuelle laboratoriene ved Institutt for laboratoriemedisin, barne og kvinnesykdommer.
Vedr. skjemaets øvrige punkter:
1B – fagfelt/forskningskategori: Det finnes ikke dekkende valg i listen. Prosjektene som benytter infrastrukturen omhandler mange ulike fagfelt og flere forskningskategorier.
1C – Prosjektet omfatter bruk av humant materiale og kan også omfatte materiale fra dyr. Det er prosjektlederne som benytter infrastrukturen som er ansvarlige for å innhente de nødvendige godkjennelser fra REK, Forsøksdyrutvalget og evt. andre instanser. Infrastrukturene brukes til å undersøke biologisk materiale, men det er ikke prosjektleder for ”Forskningsinfrastruktur ved LBK” som er ansvarlig for opprettelse av biobanker.
1D – Noen av prosjektene kan være koblet mot nasjonale kvalitetsregistre. Vi fører ikke oversikt over evt. slike koblinger.
2 – Forskningsproduksjon: Prosjektet har ingen registrering av hvilke publikasjoner som kommer ut av de enkelte studiene som benytter fasilitetene. Vi er kommet til at slik registrering ville medføre mye ekstra byråkrati. Det er også lite sannsynlig at slike oversikter ville bli fullstendige, ettersom de ulike prosjektlederne må rapportere mange andre steder. Det er også en tidsforsinkelse mellom hvilket år data er fremskaffet og når publikasjonene kommer, som ytterligere kompliserer registrering.
Prosjektet omfatter etablering og drift av infrastruktur som benyttes til å fremskaffe forskningsdata til ulike forskningsprosjekter: elektronmikroskopi (EM), histologi og gensekvensering ved Det medisinske fakultet ved NTNU.Etablerte serviceavtaler er videreført og nødvendig service gjennomført etter planen. Prosjektet finansierer også en ingeniørstilling ved EM-lab. Prosjektstøtten har vært svært viktig for driften av de aktuelle laboratoriene ved Institutt for laboratoriemedisin, barne og kvinnesykdommer.
EMLab og histologiaktivitetene er del av kjernefasiliteten CMIC. Prosjektstøtten til disse aktivitetene brukes derfor i kjernefasiliteten. Etter et snaut års drift er det tydelig at kjernefasiliteten fungerer godt og har bidratt til bedre utnyttelse av de totale ressursene som står til rådighet for de aktuelle aktivitetene.
Vedr. skjemaets øvrige punkter:
1B – fagfelt/forskningskategori: Det finnes ikke dekkende valg i listen. Prosjektene som benytter infrastrukturen omhandler mange ulike fagfelt og flere forskningskategorier.
1C – Prosjektet omfatter bruk av humant materiale og kan også omfatte materiale fra dyr. Det er prosjektlederne som benytter infrastrukturen som er ansvarlige for å innhente de nødvendige godkjennelser fra REK, Forsøksdyrutvalget og evt. andre instanser. Infrastrukturene brukes til å undersøke biologisk materiale, men det er ikke prosjektleder for ”Forskningsinfrastruktur ved LBK” som er ansvarlig for opprettelse av biobanker.
1D – Noen av prosjektene kan være koblet mot nasjonale kvalitetsregistre. Vi fører ikke oversikt over evt. slike koblinger.
2 – Forskningsproduksjon: Prosjektet har ingen registrering av hvilke publikasjoner som kommer ut av de enkelte studiene som benytter fasilitetene. Vi er kommet til at slik registrering ville medføre mye ekstra byråkrati. Det er også lite sannsynlig at slike oversikter ville bli fullstendige, ettersom de ulike prosjektlederne må rapportere mange andre steder. Det er også en tidsforsinkelse mellom hvilket år data er fremskaffet og når publikasjonene kommer, som ytterligere kompliserer registrering.
Prosjektet omfatter etablering og drift av infrastruktur som benyttes til å fremskaffe forskningsdata til ulike forskningprosjekter: elektronmikroskopi (EM), histologi og gensekvensering ved Det medisinske fakultet ved NTNU.Etablerte serviceavtaler er videreført og nødvendig service gjennomført etter planen. Ingeniørstillingen ved EM-lab tiltrådte 01.03.2011 etter at vikar hadde dekket opp fra 01.01.2011. Prosjektstøtten har vært svært viktig for driften av de aktuelle laboratoriene ved Institutt for laboratoriemedisin, barne- og kvinnesykdommer.
EM-lab og histologiaktivitetene vil bli innlemmet i en ny kjernefasilitet ved Det medisinsk fakultet fra 01.02.2012. Prosjektstøtten til disse aktivitetene vil bli brukt i kjernefasiliteten.
Vedr. skjemaets øvrige punkter:
1B – fagfelt: Det finnes ikke dekkende valg i listen. Prosjektene som benytter infrastrukturen omhandler mange ulike fagfelt.
1C – Prosjektet omfatter bruk av humant materiale og kan også omfatte materiale fra dyr. Det er prosjektlederne som benytter infrastrukturen som er ansvarlige for å innhente de nødvendige godkjennelser fra REK, Forsøksdyrutvalget og evt. andre instanser. Infrastrukturene brukes til å undersøke biologisk materiale, men det er ikke prosjektleder for ”Forskningsinfrastruktur ved LBK” som er ansvarlig for opprettelse av biobanker.
1D – Noen av prosjektene kan være koblet mot nasjonale kvalitetsregistre. Vi fører ikke oversikt over evt. slike koblinger.
2 – Forskningsproduksjon: Prosjektet har ingen registrering av hvilke publikasjoner som kommer ut av de enkelte studiene som benytter fasilitetene. Vi er kommet til at slik registrering ville medføre mye ekstra byråkrati. Det er også lite sannsynlig at slike oversikter ville bli fullstendige, ettersom de ulike prosjektlederne må rapportere mange andre steder. Det er også en tidsforsinkelse mellom hvilket år data er fremskaffet og når publikasjonene kommer, som ytterligere kompliserer registrering.
Infrastrukturstøtte til drift av sekvenseringsutstyr, elektronmikroskopilab og histologilab for DMF.Første mål i prosjektet var å etablere serviceavtaler. Dette ble utført for sekvenseringsutstyr og utstyr på histologilab så snart vi fikk skriftlig dokumentasjon på tildelingen, slik at prosjektet kunne opprettes administrativt på NTNU. Nødvendig service ble første gang utført høsten 2010. Pga forsinkelsen med prosjektetablering ble utlysning av ingeniørstilling til EM-lab også forsinket. Midlertidig vikar ble ansatt fra 01.01.2011. Stillingen ble utlyst, og vi er i ferd med å intervjue søkerne. Vi håper på tiltredelse 01.03.2011, men vil evt. forlenge vikarens ansettelse om nødvendig. Etter ansettelsen blir det mulig å beregne endelig overskytende beløp, som skal brukes til serviceavtaler for EM-lab. Disse vil deretter bli inngått. Prosjektstøtten har vært svært viktig for driften av de aktuelle laboratoriene ved LBK.
I forbindelse med DMFs utredning av mulige kjernefasiliteter har LBK spilt inn synspunkter vedrørende histologilab og EM-lab. Sekvenseringsaktivitetene er omfattet i et innspill fra IKM. Om en eller flere av infrastrukturene i prosjektet ender med å bli innkorporert i en kjernefasilitet, vil dette bli innrapportert neste år.
Vedr. skjemaets øvrige punkter:
1B – fagfelt: Det finnes ikke dekkende valg i listen. Prosjektene som benytter infrastrukturen omhandler mange ulike fagfelt.
1C – Prosjektet omfatter bruk av humant materiale og kan også omfatte materiale fra dyr. Det er prosjektlederne som benytter infrastrukturen som er ansvarlige for å innhente de nødvendige godkjennelser fra REK, Forsøksdyrutvalget og evt. andre instanser. Infrastrukturene brukes til å undersøke biologisk materiale, men det er ikke prosjektleder for ”Forskningsinfrastruktur ved LBK” som er ansvarlig for opprettelse av biobanker.
2 – Forskningsproduksjon: Prosjektet har ingen registrering av hvilke publikasjoner som kommer ut av de enkelte studiene som benytter fasilitetene. Vi er kommet til at slik registrering ville medføre mye ekstra byråkrati. Det er også lite sannsynlig at slike oversikter ville bli fullstendige, ettersom de ulike prosjektlederne må rapportere mange andre steder.
Deltagere
- Marite Rygg Prosjektleder
eRapport er utarbeidet av Sølvi Lerfald og Reidar Thorstensen, Regionalt kompetansesenter for klinisk forskning, Helse Vest RHF, og videreutvikles av de fire RHF-ene i fellesskap, med støtte fra Helse Vest IKT
Alle henvendelser rettes til Helse Midt-Norge RHF - Samarbeidsorganet og FFU