NEAT1 and drug resistance in breast cancer

Målet med dette kortidsprosjektet var å undersøke om uttrykksnivået av det lange ikke-kodende RNAet NEAT1 har påvirkning på responsen til brystkreftcellelinjer på medikamenter brukt i behandling av kreft. For å undersøke dette har prosjektet med samarbeidspartnere utviklet brystkreftcellelinjer med og uten uttrykk av NEAT1 (arbeidspakke 1). Disse cellelinjene har blitt testet for deres sensitivitet for 1520 FDA godkjente medikamenter (arbeidspakke 2). Videre har cellelinjene gjennomgått RNA-sekvensering (arbeidspakke 3). Disse arbeidspakkene tilsammen gjør at prosjektet kan undersøke hvilke egenskaper som NEAT1 kan påvirke i kreftcellene, og hvordan en endring i egenskapene kan påvirke kreftcellenes respons på ulike medikamenter. Alle eksperimentelle forsøk som var planlagt i dette korttidsprosjektet er blitt gjennomført. Det pågår fortsatt dataanalyser på innsamlet data, og det forventes at resultatene vil kunne inngå i en framtidig publikasjon. Dataen er også mulig tiltenkt å bli inkludert i en doktorgradsavhandling. Gjennom medikament screeningen har prosjektet identifisert flere ulike medikamenter som responderer forskjellig når kreftcellene enten uttrykker NEAT1 eller ikke. Dessverre, i et validerings førsøk på dose-respons kurven til 20 av disse medikamentene, hadde ingen av medikamentene signifikante resultater. RNA-sekvenseringen har videre identifisert flere gener som er ulikt uttrykt mellom kreftcellene med og uten NEAT1. Disse genene har vi brukt videre for å gjennomføre anrikningsanalyser for spesifikke signaleringsnettverk. Denne dataen gir oss en forståelse for hvordan NEAT1 påvirker kreftcellene. Det er kommet mange publikasjoner på at NEAT1 er et viktig molekyl i kreftceller som er med på å øke celledelingen og gjøre kreftcelle mer resistente mot kjemoterapi. Vi har også vist at NEAT1 er høyt uttrykt i brystkreftceller, og at molekylet ikke er uttrykt i de normale cellene i brystvevet. Videre har vi vist at NEAT1 er høyest uttrykt i HER2 positiv brystkreft. Det er derfor viktig å øke forståelsen for NEAT1 i brystkreft og hvordan høyt uttrykk av NEAT1 kan påvirke behandling av brystkreftpasienter. Dette korttidsprosjektet har generert ny data på hvordan NEAT1 kan ha en effekt på 1520 FDA godkjente medikamenter. Denne dataen, når den blir videre studert og validert, kan få konsekvenser for behandling av brystkreftpasienter med høyt uttrykt versus lavt uttrykt av NEAT1.