eRapport

Regional Human Stem Cell Research Network

Prosjekt
Prosjektnummer
2012065
Ansvarlig person
Joel C. Glover
Institusjon
Oslo universitetssykehus HF
Prosjektkategori
Regionalt forskningsnettverk
Helsekategori
Forskningsaktivitet
Rapporter
2014 - sluttrapport
Regional Human Stem Cell Research Network er et spesialisert forskningsnettverk dedisert til karakterisering av humane stamceller fra pluripotente til multipotente til differensierte former. Dette er viktig for utvikling av rasjonelle bruk av humane stamceller til terapeutisk behandling, sykdomsmodellering og testing av medikamenter. Stamceller kommer i ulike former avhengig av hvor de hentes fra og hvordan de fremstilles. Pluripotente stamceller er de som finnes på tidlige embryonale stadier eller som fremstilles ved bruk av indusert pluripotens (iPS) teknologi fra ferdig modnede celler fra voksne individer. De kan styres til å danne en hvilken som helst type kroppscelle. Multipotente stamceller finnes så å si i alle organer i den ferdig utviklede kroppen. De er med på å vedlikeholde kroppens vev og organer når celler går til grunne. Bedre genetisk, epigenetisk, og molekylær karakterisering av stamceller hentet fra ulike kilder er en forutsetning for at disse skal kunne brukes på standardiserte måter i forbindelse med terapi, sykdomsmodellering, og testing av medikamenter. Nettverket tar sikte på å kombinere et bredt spekter av teknologier til å oppnå dette målet, slik at stamcellelinjer kan fremstilles som pålitelige verktøy til spesifikke bruksområder. For eksempel er det viktig å fremstille stamceller fra normale donorer med ulike etniske og genetiske bakgrunner slik at testing av medikamenter kan munne ut i behandlinger som er skreddersydd det genetiske grunnlaget til individet. I løpet av 2014 har nettverket økt omfanget av iPS cellelinje produksjon og banking. Linjene inkluderer iPS celler fra normale donorer med ulike etniske bakgrunner og fra pasientgrupper med ulike genetiske sykdommer. iPS-cellene som fremstilles blir gjort tilgjengelig for norske forskere og kan anvendes i mange medisinske sammenhenger. Nettverket har også brukt i økende grad genmodifiseringsteknikker der gensekvenser kan settes inn i cellene, enten for å få uttrykt gener som normalt ikke uttrykkes i iPS celler fra normale donorer (for å studere cellefunksjon), eller for å reparere gendefekter i iPS celler fra pasienter med genetiske sykdommer. På denne måten kan de genreparerte iPS cellene brukes som kilder for friske celler som muligens kan anvendes til celleterapi for pasientene. Nettverket har blitt et viktig senter for undersøkelse av epigenetikk hos iPS celler og ES celler, der ulike metoder brukes til å undersøke hvordan epigenetiske forandringer i gener og deres avleste transkripter virker inn på celledifferensiering. Dette kan gi økt forståelse av hvordan celledifferensiering styres normalt. Nettverket har også etablerte 3D celleprinting som en ny teknologi i Norge, ved innkjøp av en 3D bioprinter, den første av sitt slag i Norden. Nettverkets forskningsprosjekter i 2014 har resultert i publikasjon av et stort antall (42) originalartikler som spenner fra teknologiutvikling til translasjonelle studier på pasientmateriale til kliniske studier på pasienter. Det er også forsvart 4 doktorgrader. Nettverket har også bidratt til formidling til almenheten om stamcellebiologi og stamcelleforskning via en nasjonal konferanse på Soria Moria konferansesenter (oktober 2014), websiden til Nasjonalt senter for stamcelleforskning, og via offentlig media. De ulike samarbeidsaksene i Regional Human Stem Cell Research Network har medført nye forskningsinteraksjoner som kan ha stor betydning for forståelsen av sykdomsmekanismer og for bruk av stamceller som fremtidig terapi. For eksempel har metoder innen epigenetikk, både mht DNA-modifisering, histone-modifisering, og den nyere oppdaget RNA-modifiseringen, blitt applisert på flere typer stamceller, blant annet hematopoeitiske stamceller. Dette vil føre til bedre innsikt i hvordan epigenetikk regulerer stamcellefunksjon og differensiering, og fordi epigenetikk kan påvirkes medikamentelt, også nye muligheter for behandling av sykdommer der stamcelleregulering er sentral, både når det gjelder endogene stamceller og implanterte stamceller. Et annet eksempel er etableringen av 3D celleprinting kapasitet ved nettverket, som åpner helt nye muligheter for oppbygging av mer komplekse in vitro celleplattformer for undersøkelser av cellefunksjon og differensiering, samt for oppbygging av vev og organer til erstatning hos pasienter. I denne forbindelsen har nettverk utviklet et tett samarbeid med transplantasjonskirurgene ved OUS, der utvikling av biosyntetiske organer er et hovedmål sett i lys av store avviket mellom tilgjengelighet og behov for donororganer til transplantasjon. Et tredje eksempel er nettverkets utvikling av nye måter å bruke ulike imagingplattformer til å karakterisere den funksjonelle differensieringen av stamceller og for å følge stamceller in vivo etter implantering. Disse fremskritt innen imaging kan ha store konsekvenser for etablering av robuste stamcelleterapier i fremtiden. Til sist er det viktig å understreke betydningen av den store iPS-cellesatsing som nettverket har vært involvert i. Denne har gjort det mulig å tilbuy iPS-celle produksjon til norske forskere og klinikere og åpner for helt nye sykdomsmodeller som bruker humane celler i motsetning til dyremodeller. Sammen med fremskritt innen genrevidering ("gene editing"), ser man også mulighet for å kunne lage friske autologe celler fra en pasients genetiske syke celler, slik at stamcelleterapier kan basere seg på pasienten selv som kilde. I hvertfall mht monogeniske sykdommer gir dette en spennende mulighet for fremtidig behandling.
2013
Regional Human Stem Cell Research Network er et spesialisert forskningsnettverk dedisert til karakterisering av humane stamceller fra pluripotente til multipotente til differensierte former. Dette er viktig for utvikling av rasjonelle bruk av humane stamceller til terapeutisk behandling, sykdomsmodellering og testing av medikamenter.Stamceller kommer i ulike former avhengig av hvor de hentes fra og hvordan de fremstilles. Pluripotente stamceller er de som finnes på tidlige embryonale stadier eller som fremstilles ved bruk av indusert pluripotens (iPS) teknologi fra ferdig modnede celler fra voksne individer. De kan styres til å danne en hvilken som helst type kroppscelle. Multipotente stamceller finnes så å si i alle organer i den ferdig utviklede kroppen. De er med på å vedlikeholde kroppens vev og organer når celler går til grunne. Bedre genetisk, epigenetisk, og molekylær karakterisering av stamceller hentet fra ulike kilder er en forutsetning for at disse skal kunne brukes på standardiserte måter i forbindelse med terapi, sykdomsmodellering, og testing av medikamenter. Nettverket tar sikte på å kombinere et bredt spekter av teknologier til å oppnå dette målet, slik at stamcellelinjer kan fremstilles som pålitelige verktøy til spesifikke bruksområder. For eksempel er det viktig å fremstille stamceller fra normale donorer med ulike etniske og genetiske bakgrunner slik at testing av medikamenter kan munne ut i behandlinger som er skreddersydd det genetiske grunnlaget til individet. I løpet av 2013 har nettverket etablert en rekke iPS cellelinjer sammen med sine utenlandske og norske samarbeidspartnere, og etablert den nødvendige infrastrukturen for biobanking av disse. LInjene inkluderer iPS celler fra normale donorer med ulike etniske bakgrunner og fra pasientgrupper med ulike genetiske sykdommer. iPS-cellene som fremstilles blir gjort tilgjengelig for norske forskere og kan anvendes i mange medisinske sammenhenger. Nettverket har også etablert nye genmodifiseringsteknikker der gensekvenser kan settes inn i cellene, enten for å få uttrykt gener som normalt ikke uttrykkes i iPS celler fra normale donorer (for å studere cellefunksjon), eller for å reparere gendefekter i iPS celler fra pasienter med genetiske sykdommer. På denne måten kan de genreparerte iPS cellene brukes som kilder for friske celler som muligens kan anvendes til celleterapi for pasientene. Nettverket har også etablert en rekke metoder for å undersøke epigenetikk hos iPS cellene, og begynt å ta disse i bruk for å undersøke hvordan epigenetiske forandringer i gener og deres avleste transkripter virker inn på celledifferensiering. Dette kan gi økt forståelse av hvordan celledifferensiering styres normalt. Nettverkets forskningsprosjekter i 2013 har resultert i publikasjon av et stort antall (56) originalartikler som spenner fra teknologiutvikling til translasjonelle studier på pasientmateriale til kliniske studier på pasienter. Nettverket har også bidratt til formidling til almenheten om stamcellebiologi og stamcelleforskning via en nasjonal konferanse på Soria Moria konferansesenter (oktober 2013), websiden til Nasjonalt senter for stamcelleforskning, og via offentlig media.
2012
Regional Human Stem Cell Research Network er et spesialisert forskningsnettverk dedisert til karakterisering av humane stamceller fra pluripotente til multipotente til differensierte former. Dette er viktig for utvikling av rasjonelle bruk av humane stamceller til terapeutisk behandling, sykdomsmodellering og testing av medikamenter.Stamceller kommer i ulike former avhengig av hvor de hentes fra og hvordan de fremstilles. Pluripotente stamceller er de som finnes på tidlige embryonale stadier eller som fremstilles ved bruk av indusert pluripotens (iPS) teknologi fra ferdig modnede celler fra voksne individer. De kan styres til å danne en hvilken som helst type kroppscelle. Multipotente stamceller finnes så å si i alle organer i den ferdig utviklede kroppen. De er med på å vedlikeholde kroppens vev og organer når celler går til grunne. Bedre genetisk, epigenetisk, og molekylær karakterisering av stamceller hentet fra ulike kilder er en forutsetning for at disse skal kunne brukes på standardiserte måter i forbindelse med terapi, sykdomsmodellering, og testing av medikamenter. Nettverket tar sikte på å kombinere et bredt spekter av teknologier til å oppnå dette målet, slik at stamcellelinjer kan fremstilles som pålitelige verktøy til spesifikke bruksområder. For eksempel er det viktig å fremstille stamceller fra normale donorer med ulike etniske og genetiske bakgrunner slik at testing av medikamenter kan munne ut i behandlinger som er skreddersydd det genetiske grunnlaget til individet. I løpet av 2012 har nettverket etablert såkalt "standard operating procedures" (SOPer) for fremstilling av hES celler og iPS celler. Flere hES cellelinjer er nå gjort tilgjengelig og karakterisering av deres evne til å danne ulike celletyper er i gang. Nettverket har også, i samarbeid med sine utenlandske partnere og norkse klinikere, begynt å fremstille iPS celler fra normale donorer med ulike etniske bakgrunner og fra pasientgrupper med ulike genetiske sykdommer. Nettverket tar sikte på å etablere en biobank av iPS-cellene som fremstilles slik at disse er tilgjengelig og kan anvendes i mange medisinske sammenhenger i fremtiden. Nettverkets forskningsprosjekter i 2012 har resultert i publikasjon av et stort antall (36) originalartikler som spenner fra teknologiutvikling til translasjonelle studier på pasientmateriale til kliniske studier på pasienter. Nettverket har også bidratt til formidling til almenheten om stamcellebiologi og stamcelleforskning via en nasjonal konferanse, websiden til Nasjonalt senter for stamcelleforskning, og kronikk i offentlig media.
Vitenskapelige artikler
Sivertsen Magne S, Glover Joel C, Perreault Marie-Claude

Organization of pontine reticulospinal inputs to motoneurons controlling axial and limb muscles in the neonatal mouse.

J Neurophysiol 2014 Oct 1;112(7):1628-43. Epub 2014 jun 18

PMID: 24944221

Bjørnstad Sigrid, Paulsen Ragnhild E, Erichsen Aage, Glover Joel C, Roald Borghild

Type I and II pneumocyte differentiation in the developing fetal chicken lung: conservation of pivotal proteins from birds to human in the struggle for life at birth.

Neonatology 2014;105(2):112-20. Epub 2013 des 6

PMID: 24335141

Shah Akshay, Oldenburg Anja, Collas Philippe

A hyper-dynamic nature of bivalent promoter states underlies coordinated developmental gene expression modules.

BMC Genomics 2014;15():1186. Epub 2014 des 30

PMID: 25551786

Vadrot N, Duband-Goulet I, Cabet E, Attanda W, Barateau A, Vicart P, Gerbal F, Briand N, Vigouroux C, Oldenburg AR, Lund EG, Collas P, Buendia B

The p.R482W substitution in A-type lamins deregulates SREBP1 activity in Dunnigan-type familial partial lipodystrophy.

Hum Mol Genet 2015 Apr 1;24(7):2096-109. Epub 2014 des 18

PMID: 25524705

Ostrup Olga, Reiner Andrew H, Aleström Peter, Collas Philippe

The specific alteration of histone methylation profiles by DZNep during early zebrafish development.

Biochim Biophys Acta 2014 Nov;1839(11):1307-15. Epub 2014 sep 28

PMID: 25260724

Ivanauskiene Kristina, Delbarre Erwan, McGhie James D, Küntziger Thomas, Wong Lee H, Collas Philippe

The PML-associated protein DEK regulates the balance of H3.3 loading on chromatin and is important for telomere integrity.

Genome Res 2014 Oct;24(10):1584-94. Epub 2014 jul 21

PMID: 25049225

Lund Eivind, Oldenburg Anja R, Collas Philippe

Enriched domain detector: a program for detection of wide genomic enrichment domains robust against local variations.

Nucleic Acids Res 2014 Jun;42(11):e92. Epub 2014 apr 29

PMID: 24782521

Aanes Håvard, Winata Cecilia, Moen Lars F, Østrup Olga, Mathavan Sinnakaruppan, Collas Philippe, Rognes Torbjørn, Aleström Peter

Normalization of RNA-sequencing data from samples with varying mRNA levels.

PLoS One 2014;9(2):e89158. Epub 2014 feb 25

PMID: 24586560

Aanes Håvard, Collas Philippe, Aleström Peter

Transcriptome dynamics and diversity in the early zebrafish embryo.

Brief Funct Genomics 2014 Mar;13(2):95-105. Epub 2013 des 12

PMID: 24335756

Collas Philippe, Lund Eivind G, Oldenburg Anja R

Closing the (nuclear) envelope on the genome: how nuclear lamins interact with promoters and modulate gene expression.

Bioessays 2014 Jan;36(1):75-83. Epub 2013 nov 24

PMID: 24272858

Oldenburg Anja R, Delbarre Erwan, Thiede Bernd, Vigouroux Corinne, Collas Philippe

Deregulation of Fragile X-related protein 1 by the lipodystrophic lamin A p.R482W mutation elicits a myogenic gene expression program in preadipocytes.

Hum Mol Genet 2014 Mar 1;23(5):1151-62. Epub 2013 okt 9

PMID: 24108105

Klein Gerd, Hart Melanie L, Brinchmann Jan E, Rolauffs Bernd, Stenzl Arnulf, Sievert Karl-Dietrich, Aicher Wilhelm K

Mesenchymal stromal cells for sphincter regeneration.

Adv Drug Deliv Rev 2014 Oct 27. Epub 2014 okt 27

PMID: 25451135

Jakobsen Rune B, Østrup Esben, Zhang Xiaolan, Mikkelsen Tarjei S, Brinchmann Jan E

Analysis of the effects of five factors relevant to in vitro chondrogenesis of human mesenchymal stem cells using factorial design and high throughput mRNA-profiling.

PLoS One 2014;9(5):e96615. Epub 2014 mai 9

PMID: 24816923

Pullisaar Helen, Reseland Janne E, Haugen Håvard J, Brinchmann Jan E, Ostrup Esben

Simvastatin coating of TiO2 scaffold induces osteogenic differentiation of human adipose tissue-derived mesenchymal stem cells.

Biochem Biophys Res Commun 2014 Apr 25;447(1):139-44. Epub 2014 apr 2

PMID: 24704451

Olderøy Magnus Ø, Lilledahl Magnus B, Beckwith Marianne Sandvold, Melvik Jan Egil, Reinholt Finn, Sikorski Pawel, Brinchmann Jan E

Biochemical and structural characterization of neocartilage formed by mesenchymal stem cells in alginate hydrogels.

PLoS One 2014;9(3):e91662. Epub 2014 mar 13

PMID: 24626259

Herlofsen Sarah R, Høiby Torill, Cacchiarelli Davide, Zhang Xiaolan, Mikkelsen Tarjei S, Brinchmann Jan E

Brief report: importance of SOX8 for in vitro chondrogenic differentiation of human mesenchymal stromal cells.

Stem Cells 2014 Jun;32(6):1629-35.

PMID: 24449344

Karlsen Tommy A, Jakobsen Rune B, Mikkelsen Tarjei S, Brinchmann Jan E

microRNA-140 targets RALA and regulates chondrogenic differentiation of human mesenchymal stem cells by translational enhancement of SOX9 and ACAN.

Stem Cells Dev 2014 Feb 1;23(3):290-304. Epub 2013 nov 7

PMID: 24063364

Sandberg Cecilie Jonsgar, Vik-Mo Einar O, Behnan Jinan, Helseth Eirik, Langmoen Iver A

Transcriptional profiling of adult neural stem-like cells from the human brain.

PLoS One 2014;9(12):e114739. Epub 2014 des 16

PMID: 25514637

Behnan Jinan, Isakson Pauline, Joel Mrinal, Cilio Corrado, Langmoen Iver A, Vik-Mo Einar O, Badn Wiaam

Recruited brain tumor-derived mesenchymal stem cells contribute to brain tumor progression.

Stem Cells 2014 May;32(5):1110-23.

PMID: 24302539

Subklewe Marion, Geiger Christiane, Lichtenegger Felix S, Javorovic Miran, Kvalheim Gunnar, Schendel Dolores J, Bigalke Iris

New generation dendritic cell vaccine for immunotherapy of acute myeloid leukemia.

Cancer Immunol Immunother 2014 Oct;63(10):1093-103. Epub 2014 sep 4

PMID: 25186611

Husøy Magnus Andreas Rognlien, Brinch Lorentz, Tjønnfjord Geir E, Gedde-Dahl Tobias, Heldal Dag, Holme Pål André, Dybedal Ingunn, Kolstad Arne, Akkök Çigdem Akalin, Rollag Halvor, Gaustad Peter, Bergan Stein, Egeland Torstein, Josefsen Dag, Kvalheim Gunnar, Fløisand Yngvar

[Allogeneic stem-cell transplantation in adults 1985-2012: results and development].

Tidsskr Nor Laegeforen 2014 Sep 2;134(16):1569-75. Epub 2014 sep 2

PMID: 25178233

Skårn Magne, Noordhuis Paul, Wang Meng-Yu, Veuger Marjan, Kresse Stine Henrichson, Egeland Eivind Valen, Micci Francesca, Namløs Heidi Maria, Håkelien Anne-Mari, Olafsrud Solveig Mjelstad, Lorenz Susanne, Haraldsen Guttorm, Kvalheim Gunnar, Meza-Zepeda Leonardo Andrés, Myklebost Ola

Generation and characterization of an immortalized human mesenchymal stromal cell line.

Stem Cells Dev 2014 Oct 1;23(19):2377-89. Epub 2014 jun 30

PMID: 24857590

Woll Petter S, Kjällquist Una, Chowdhury Onima, Doolittle Helen, Wedge David C, Thongjuea Supat, Erlandsson Rikard, Ngara Mtakai, Anderson Kristina, Deng Qiaolin, Mead Adam J, Stenson Laura, Giustacchini Alice, Duarte Sara, Giannoulatou Eleni, Taylor Stephen, Karimi Mohsen, Scharenberg Christian, Mortera-Blanco Teresa, Macaulay Iain C, Clark Sally-Ann, Dybedal Ingunn, Josefsen Dag, Fenaux Pierre, Hokland Peter, Holm Mette S, Cazzola Mario, Malcovati Luca, Tauro Sudhir, Bowen David, Boultwood Jacqueline, Pellagatti Andrea, Pimanda John E, Unnikrishnan Ashwin, Vyas Paresh, Göhring Gudrun, Schlegelberger Brigitte, Tobiasson Magnus, Kvalheim Gunnar, Constantinescu Stefan N, Nerlov Claus, Nilsson Lars, Campbell Peter J, Sandberg Rickard, Papaemmanuil Elli, Hellström-Lindberg Eva, Linnarsson Sten, Jacobsen Sten Eirik W

Myelodysplastic syndromes are propagated by rare and distinct human cancer stem cells in vivo.

Cancer Cell 2014 Jun 16;25(6):794-808. Epub 2014 mai 15

PMID: 24835589

Garsed Dale W, Marshall Owen J, Corbin Vincent D A, Hsu Arthur, Di Stefano Leon, Schröder Jan, Li Jason, Feng Zhi-Ping, Kim Bo W, Kowarsky Mark, Lansdell Ben, Brookwell Ross, Myklebost Ola, Meza-Zepeda Leonardo, Holloway Andrew J, Pedeutour Florence, Choo K H Andy, Damore Michael A, Deans Andrew J, Papenfuss Anthony T, Thomas David M

The architecture and evolution of cancer neochromosomes.

Cancer Cell 2014 Nov 10;26(5):653-67. Epub 2014 nov 10

PMID: 25517748

Wennerström Anna B, Lothe Inger Marie Bowitz, Sandhu Vandana, Kure Elin H, Myklebost Ola, Munthe Else

Generation and characterisation of novel pancreatic adenocarcinoma xenograft models and corresponding primary cell lines.

PLoS One 2014;9(8):e103873. Epub 2014 aug 22

PMID: 25148029

Tubio Jose M C, Li Yilong, Ju Young Seok, Martincorena Inigo, Cooke Susanna L, Tojo Marta, Gundem Gunes, Pipinikas Christodoulos P, Zamora Jorge, Raine Keiran, Menzies Andrew, Roman-Garcia Pablo, Fullam Anthony, Gerstung Moritz, Shlien Adam, Tarpey Patrick S, Papaemmanuil Elli, Knappskog Stian, Van Loo Peter, Ramakrishna Manasa, Davies Helen R, Marshall John, Wedge David C, Teague Jon W, Butler Adam P, Nik-Zainal Serena, Alexandrov Ludmil, Behjati Sam, Yates Lucy R, Bolli Niccolo, Mudie Laura, Hardy Claire, Martin Sancha, McLaren Stuart, O'Meara Sarah, Anderson Elizabeth, Maddison Mark, Gamble Stephen, ICGC Breast Cancer Group, ICGC Bone Cancer Group, ICGC Prostate Cancer Group, Foster Christopher, Warren Anne Y, Whitaker Hayley, Brewer Daniel, Eeles Rosalind, Cooper Colin, Neal David, Lynch Andy G, Visakorpi Tapio, Isaacs William B, van't Veer Laura, Caldas Carlos, Desmedt Christine, Sotiriou Christos, Aparicio Sam, Foekens John A, Eyfjörd Jórunn Erla, Lakhani Sunil R, Thomas Gilles, Myklebost Ola, Span Paul N, Børresen-Dale Anne-Lise, Richardson Andrea L, van de Vijver Marc, Vincent-Salomon Anne, Van den Eynden Gert G, Flanagan Adrienne M, Futreal P Andrew, Janes Sam M, Bova G Steven, Stratton Michael R, McDermott Ultan, Campbell Peter J

Mobile DNA in cancer. Extensive transduction of nonrepetitive DNA mediated by L1 retrotransposition in cancer genomes.

Science 2014 Aug 1;345(6196):1251343.

PMID: 25082706

Chilamakuri Chandra Sekhar Reddy, Lorenz Susanne, Madoui Mohammed-Amin, Vodák Daniel, Sun Jinchang, Hovig Eivind, Myklebost Ola, Meza-Zepeda Leonardo A

Performance comparison of four exome capture systems for deep sequencing.

BMC Genomics 2014;15():449. Epub 2014 jun 9

PMID: 24912484

Barøy Tale, Kresse Stine H, Skårn Magne, Stabell Marianne, Castro Russell, Lauvrak Silje, Llombart-Bosch Antonio, Myklebost Ola, Meza-Zepeda Leonardo A

Reexpression of LSAMP inhibits tumor growth in a preclinical osteosarcoma model.

Mol Cancer 2014;13():93. Epub 2014 apr 28

PMID: 24885297

Håkelien Anne-Mari, Bryne Jan Christian, Harstad Kristine G, Lorenz Susanne, Paulsen Jonas, Sun Jinchang, Mikkelsen Tarjei S, Myklebost Ola, Meza-Zepeda Leonardo A

The regulatory landscape of osteogenic differentiation.

Stem Cells 2014 Oct;32(10):2780-93.

PMID: 24898411

Stratford Eva Wessel, Daffinrud Jeanette, Munthe Else, Castro Russell, Waaler Jo, Krauss Stefan, Myklebost Ola

The tankyrase-specific inhibitor JW74 affects cell cycle progression and induces apoptosis and differentiation in osteosarcoma cell lines.

Cancer Med 2014 Feb;3(1):36-46. Epub 2013 des 17

PMID: 24403055

Andjelic Sofija, Lumi Xhevat, Yan Xiaohe, Graw Jochen, Moe Morten C, Facskó Andrea, Hawlina Marko, Petrovski Goran

Characterization of ex vivo cultured neuronal- and glial- like cells from human idiopathic epiretinal membranes.

BMC Ophthalmol 2014;14():165. Epub 2014 des 23

PMID: 25540050

Yang Mingyi, Luna Luisa, Sørbø Jan Gunnar, Alseth Ingrun, Johansen Rune F, Backe Paul H, Danbolt Niels C, Eide Lars, Bjørås Magnar

Human OXR1 maintains mitochondrial DNA integrity and counteracts hydrogen peroxide-induced oxidative stress by regulating antioxidant pathways involving p21.

Free Radic Biol Med 2014 Dec;77():41-8. Epub 2014 sep 16

PMID: 25236744

Alseth Ingrun, Dalhus Bjørn, Bjørås Magnar

Inosine in DNA and RNA.

Curr Opin Genet Dev 2014 Jun;26():116-23. Epub 2014 aug 30

PMID: 25173738

Stray-Pedersen Asbjørg, Backe Paul H, Sorte Hanne S, Mørkrid Lars, Chokshi Niti Y, Erichsen Hans Christian, Gambin Tomasz, Elgstøen Katja B P, Bjørås Magnar, Wlodarski Marcin W, Krüger Marcus, Jhangiani Shalini N, Muzny Donna M, Patel Ankita, Raymond Kimiyo M, Sasa Ghadir S, Krance Robert A, Martinez Caridad A, Abraham Shirley M, Speckmann Carsten, Ehl Stephan, Hall Patricia, Forbes Lisa R, Merckoll Else, Westvik Jostein, Nishimura Gen, Rustad Cecilie F, Abrahamsen Tore G, Rønnestad Arild, Osnes Liv T, Egeland Torstein, Rødningen Olaug K, Beck Christine R, Baylor-Johns Hopkins Center for Mendelian Genomics, Boerwinkle Eric A, Gibbs Richard A, Lupski James R, Orange Jordan S, Lausch Ekkehart, Hanson I Celine

PGM3 mutations cause a congenital disorder of glycosylation with severe immunodeficiency and skeletal dysplasia.

Am J Hum Genet 2014 Jul 3;95(1):96-107. Epub 2014 jun 12

PMID: 24931394

Wang Wei, Scheffler Katja, Esbensen Ying, Strand Janne M, Stewart James B, Bjørås Magnar, Eide Lars

Addressing RNA integrity to determine the impact of mitochondrial DNA mutations on brain mitochondrial function with age.

PLoS One 2014;9(5):e96940. Epub 2014 mai 12

PMID: 24819950

Strand Janne M, Scheffler Katja, Bjørås Magnar, Eide Lars

The distribution of DNA damage is defined by region-specific susceptibility to DNA damage formation rather than repair differences.

DNA Repair (Amst) 2014 Jun;18():44-51. Epub 2014 mar 27

PMID: 24685126

Aamann Maria D, Hvitby Christina, Popuri Venkateswarlu, Muftuoglu Meltem, Lemminger Lasse, Skeby Cecilie K, Keijzers Guido, Ahn Byungchan, Bjørås Magnar, Bohr Vilhelm A, Stevnsner Tinna

Cockayne Syndrome group B protein stimulates NEIL2 DNA glycosylase activity.

Mech Ageing Dev 2014 Jan;135():1-14. Epub 2014 jan 7

PMID: 24406253

Robertson Adam B, Robertson Julia, Fusser Markus, Klungland Arne

Endonuclease G preferentially cleaves 5-hydroxymethylcytosine-modified DNA creating a substrate for recombination.

Nucleic Acids Res 2014 Dec 1;42(21):13280-93. Epub 2014 okt 29

PMID: 25355512

Nilsen Anja, Fusser Markus, Greggains Gareth, Fedorcsak Peter, Klungland Arne

ALKBH4 depletion in mice leads to spermatogenic defects.

PLoS One 2014;9(8):e105113. Epub 2014 aug 25

PMID: 25153837

Klungland Arne, Dahl John Arne

Dynamic RNA modifications in disease.

Curr Opin Genet Dev 2014 Jun;26():47-52. Epub 2014 jul 5

PMID: 25005745

Robertson Adam B, Dahl John Arne, Klungland Arne

DNA metabolism: bases of DNA repair and regulation.

Nat Chem Biol 2014 Jul;10(7):487-8.

PMID: 24937064

Preda Mihai Bogdan, Rønningen Torunn, Burlacu Alexandrina, Simionescu Maya, Moskaug Jan Øivind, Valen Guro

Remote transplantation of mesenchymal stem cells protects the heart against ischemia-reperfusion injury.

Stem Cells 2014 Aug;32(8):2123-34.

PMID: 24578312

Di Bonito Maria, Glover Joel C, Studer Michèle

Hox genes and region-specific sensorimotor circuit formation in the hindbrain and spinal cord.

Dev Dyn 2013 Dec;242(12):1348-68. Epub 2013 nov 8

PMID: 23996673

Boulland Jean-Luc, Lambert François M, Züchner Mark, Ström Susanne, Glover Joel C

A neonatal mouse spinal cord injury model for assessing post-injury adaptive plasticity and human stem cell integration.

PLoS One 2013;8(8):e71701. Epub 2013 aug 19

PMID: 23990976

Joel Mrinal, Sandberg Cecilie J, Boulland Jean-Luc, Vik-Mo Einar O, Langmoen Iver A, Glover Joel C

Inhibition of tumor formation and redirected differentiation of glioblastoma cells in a xenotypic embryonic environment.

Dev Dyn 2013 Sep;242(9):1078-93. Epub 2013 jul 29

PMID: 23780720

Perreault Marie-Claude, Glover Joel C

Glutamatergic reticulospinal neurons in the mouse: developmental origins, axon projections, and functional connectivity.

Ann N Y Acad Sci 2013 Mar;1279():80-9.

PMID: 23531005

Lund Eivind, Collas Philippe

Nuclear lamins: Making contacts with promoters.

Nucleus 2013 Nov 8;4(6). Epub 2013 nov 8

PMID: 24213377

Lund Eivind, Oldenburg Anja R, Delbarre Erwan, Freberg Christel T, Duband-Goulet Isabelle, Eskeland Ragnhild, Buendia Brigitte, Collas Philippe

Lamin A/C-promoter interactions specify chromatin state-dependent transcription outcomes.

Genome Res 2013 Oct;23(10):1580-9. Epub 2013 jul 16

PMID: 23861385

Hemmingsen Mette, Vedel Søren, Skafte-Pedersen Peder, Sabourin David, Collas Philippe, Bruus Henrik, Dufva Martin

The role of paracrine and autocrine signaling in the early phase of adipogenic differentiation of adipose-derived stem cells.

PLoS One 2013;8(5):e63638. Epub 2013 mai 28

PMID: 23723991

Aanes Håvard, Østrup Olga, Andersen Ingrid S, Moen Lars F, Mathavan Sinnakaruppan, Collas Philippe, Alestrom Peter

Differential transcript isoform usage pre- and post-zygotic genome activation in zebrafish.

BMC Genomics 2013;14():331. Epub 2013 mai 15

PMID: 23676078

Østrup Olga, Olbricht Gayla, Østrup Esben, Hyttel Poul, Collas Philippe, Cabot Ryan

RNA profiles of porcine embryos during genome activation reveal complex metabolic switch sensitive to in vitro conditions.

PLoS One 2013;8(4):e61547. Epub 2013 apr 29

PMID: 23637850

Andersen Ingrid S, Lindeman Leif C, Reiner Andrew H, Østrup Olga, Aanes Håvard, Aleström Peter, Collas Philippe

Epigenetic marking of the zebrafish developmental program.

Curr Top Dev Biol 2013;104():85-112.

PMID: 23587239

Collas Philippe, Eskeland Ragnhild

Oslo Epigenetics Symposium 2012. Oslo, Norway, 8-9 November 2012.

Epigenomics 2013 Feb;5(1):29-32.

PMID: 23414317

Herlofsen Sarah R, Bryne Jan Christian, Høiby Torill, Wang Li, Issner Robbyn, Zhang Xiaolan, Coyne Michael J, Boyle Patrick, Gu Hongcang, Meza-Zepeda Leonardo A, Collas Philippe, Mikkelsen Tarjei S, Brinchmann Jan E

Genome-wide map of quantified epigenetic changes during in vitro chondrogenic differentiation of primary human mesenchymal stem cells.

BMC Genomics 2013;14():105. Epub 2013 feb 15

PMID: 23414147

Herrmann Doris, Dahl John Arne, Lucas-Hahn Andrea, Collas Philippe, Niemann Heiner

Histone modifications and mRNA expression in the inner cell mass and trophectoderm of bovine blastocysts.

Epigenetics 2013 Mar;8(3):281-9. Epub 2013 feb 13

PMID: 23406883

Delbarre Erwan, Ivanauskiene Kristina, Küntziger Thomas, Collas Philippe

DAXX-dependent supply of soluble (H3.3-H4) dimers to PML bodies pending deposition into chromatin.

Genome Res 2013 Mar;23(3):440-51. Epub 2012 des 5

PMID: 23222847

Østrup Olga, Andersen Ingrid S, Collas Philippe

Chromatin-linked determinants of zygotic genome activation.

Cell Mol Life Sci 2013 Apr;70(8):1425-37. Epub 2012 sep 11

PMID: 22965566

Jonson Ida, Ougland Rune, Klungland Arne, Larsen Elisabeth

Oxidative stress causes DNA triplet expansion in Huntington's disease mouse embryonic stem cells.

Stem Cell Res 2013 Nov;11(3):1264-71. Epub 2013 aug 27

PMID: 24041806

Li Ming-Ming, Nilsen Anja, Shi Yue, Fusser Markus, Ding Yue-He, Fu Ye, Liu Bo, Niu Yamei, Wu Yong-Sheng, Huang Chun-Min, Olofsson Maria, Jin Kang-Xuan, Lv Ying, Xu Xing-Zhi, He Chuan, Dong Meng-Qiu, Rendtlew Danielsen Jannie M, Klungland Arne, Yang Yun-Gui

ALKBH4-dependent demethylation of actin regulates actomyosin dynamics.

Nat Commun 2013;4():1832.

PMID: 23673617

Furu Kari, Klungland Arne

Tzfp represses the androgen receptor in mouse testis.

PLoS One 2013;8(4):e62314. Epub 2013 apr 25

PMID: 23634227

Zheng Guanqun, Dahl John Arne, Niu Yamei, Fu Ye, Klungland Arne, Yang Yun-Gui, He Chuan

Sprouts of RNA epigenetics: the discovery of mammalian RNA demethylases.

RNA Biol 2013 Jun;10(6):915-8. Epub 2013 apr 17

PMID: 23619745

Solberg Anja, Robertson Adam B, Aronsen Jan Magnus, Rognmo Øivind, Sjaastad Ivar, Wisløff Ulrik, Klungland Arne

Deletion of mouse Alkbh7 leads to obesity.

J Mol Cell Biol 2013 Jun;5(3):194-203. Epub 2013 apr 8

PMID: 23572141

Zheng Guanqun, Dahl John Arne, Niu Yamei, Fedorcsak Peter, Huang Chun-Min, Li Charles J, Vågbø Cathrine B, Shi Yue, Wang Wen-Ling, Song Shu-Hui, Lu Zhike, Bosmans Ralph P G, Dai Qing, Hao Ya-Juan, Yang Xin, Zhao Wen-Ming, Tong Wei-Min, Wang Xiu-Jie, Bogdan Florian, Furu Kari, Fu Ye, Jia Guifang, Zhao Xu, Liu Jun, Krokan Hans E, Klungland Arne, Yang Yun-Gui, He Chuan

ALKBH5 is a mammalian RNA demethylase that impacts RNA metabolism and mouse fertility.

Mol Cell 2013 Jan 10;49(1):18-29. Epub 2012 nov 21

PMID: 23177736

Zhang Xiao, Shi Ming, Bjørås Magnar, Wang Wei, Zhang Guangyun, Han Junliang, Liu Zhirong, Zhang Yunxia, Wang Bing, Chen Jing, Zhu Yi, Xiong Lize, Zhao Gang

Ginsenoside Rd promotes glutamate clearance by up-regulating glial glutamate transporter GLT-1 via PI3K/AKT and ERK1/2 pathways.

Front Pharmacol 2013;4():152. Epub 2013 des 11

PMID: 24376419

Jalland Clara M O, Benestad Sylvie L, Ersdal Cecilie, Scheffler Katja, Suganthan Rajikala, Nakabeppu Yusaku, Eide Lars, Bjørås Magnar, Tranulis Michael A

Accelerated clinical course of prion disease in mice compromised in repair of oxidative DNA damage.

Free Radic Biol Med 2013 Dec 1;68C():1-7. Epub 2013 des 1

PMID: 24296244

Zimmermann Christine, Santos Aline, Gable Kenneth, Epstein Sharon, Gururaj Charulatha, Chymkowitch Pierre, Pultz Dennis, Rødkær Steven V, Clay Lorena, Bjørås Magnar, Barral Yves, Chang Amy, Færgeman Nils J, Dunn Teresa M, Riezman Howard, Enserink Jorrit M

TORC1 inhibits GSK3-mediated Elo2 phosphorylation to regulate very long chain fatty acid synthesis and autophagy.

Cell Rep 2013 Nov 27;5(4):1036-46. Epub 2013 nov 14

PMID: 24239358

Krokeide Silje Z, Laerdahl Jon K, Salah Medya, Luna Luisa, Cederkvist F Henning, Fleming Aaron M, Burrows Cynthia J, Dalhus Bjørn, Bjørås Magnar

Human NEIL3 is mainly a monofunctional DNA glycosylase removing spiroimindiohydantoin and guanidinohydantoin.

DNA Repair (Amst) 2013 Dec;12(12):1159-64. Epub 2013 jun 5

PMID: 23755964

Simonelli Valeria, Camerini Serena, Mazzei Filomena, Van Loon Barbara, Allione Alessandra, D'Errico Mariarosaria, Barone Flavia, Minoprio Anna, Ricceri Fulvio, Guarrera Simonetta, Russo Alessia, Dalhus Bjørn, Crescenzi Marco, Hübscher Ulrich, Bjørås Magnar, Matullo Giuseppe, Dogliotti Eugenia

Genotype-phenotype analysis of S326C OGG1 polymorphism: a risk factor for oxidative pathologies.

Free Radic Biol Med 2013 Oct;63():401-9. Epub 2013 mai 28

PMID: 23726996

Backe Paul H, Simm Roger, Laerdahl Jon K, Dalhus Bjørn, Fagerlund Annette, Okstad Ole A, Rognes Torbjørn, Alseth Ingrun, Kolstø Anne-Brit, Bjørås Magnar

A new family of proteins related to the HEAT-like repeat DNA glycosylases with affinity for branched DNA structures.

J Struct Biol 2013 Jul;183(1):66-75. Epub 2013 apr 25

PMID: 23623903

Krokan Hans E, Bjørås Magnar

Base excision repair.

Cold Spring Harb Perspect Biol 2013 Apr;5(4):a012583. Epub 2013 apr 1

PMID: 23545420

Weel-Sneve Ragnhild, Kristiansen Knut Ivan, Odsbu Ingvild, Dalhus Bjørn, Booth James, Rognes Torbjørn, Skarstad Kirsten, Bjørås Magnar

Single transmembrane peptide DinQ modulates membrane-dependent activities.

PLoS Genet 2013;9(2):e1003260. Epub 2013 feb 7

PMID: 23408903

Rosnes Ida, Rowe Alexander D, Vik Erik S, Forstrøm Rune Johansen, Alseth Ingrun, Bjørås Magnar, Dalhus Bjørn

Structural basis of DNA loop recognition by endonuclease V.

Structure 2013 Feb 5;21(2):257-65. Epub 2013 jan 11

PMID: 23313664

Rolseth Veslemøy, Krokeide Silje Zandstra, Kunke David, Neurauter Christine Gran, Suganthan Rajikala, Sejersted Yngve, Hildrestrand Gunn Annette, Bjørås Magnar, Luna Luisa

Loss of Neil3, the major DNA glycosylase activity for removal of hydantoins in single stranded DNA, reduces cellular proliferation and sensitizes cells to genotoxic stress.

Biochim Biophys Acta 2013 May;1833(5):1157-64. Epub 2013 jan 7

PMID: 23305905

Jobert Laure, Skjeldam Hanne K, Dalhus Bjørn, Galashevskaya Anastasia, Vågbø Cathrine Broberg, Bjørås Magnar, Nilsen Hilde

The human base excision repair enzyme SMUG1 directly interacts with DKC1 and contributes to RNA quality control.

Mol Cell 2013 Jan 24;49(2):339-45. Epub 2012 des 13

PMID: 23246433

Dalhus Bjørn, Nilsen Line, Korvald Hanne, Huffman Joy, Forstrøm Rune Johansen, McMurray Cynthia T, Alseth Ingrun, Tainer John A, Bjørås Magnar

Sculpting of DNA at abasic sites by DNA glycosylase homolog mag2.

Structure 2013 Jan 8;21(1):154-66. Epub 2012 des 13

PMID: 23245849

Dajani Rana, Koo Sung-Eun, Sullivan Gareth J, Park In-Hyun

Investigation of Rett syndrome using pluripotent stem cells.

J Cell Biochem 2013 Nov;114(11):2446-53.

PMID: 23744605

Bilican Bilada, Serio Andrea, Barmada Sami J, Nishimura Agnes Lumi, Sullivan Gareth J, Carrasco Monica, Phatnani Hemali P, Puddifoot Clare A, Story David, Fletcher Judy, Park In-Hyun, Friedman Brad A, Daley George Q, Wyllie David J A, Hardingham Giles E, Wilmut Ian, Finkbeiner Steven, Maniatis Tom, Shaw Christopher E, Chandran Siddharthan

Comment on "Drug screening for ALS using patient-specific induced pluripotent stem cells".

Sci Transl Med 2013 Jun 5;5(188):188le2.

PMID: 23740897

Siller Richard, Greenhough Sebastian, Park In-Hyun, Sullivan Gareth J

Modelling human disease with pluripotent stem cells.

Curr Gene Ther 2013 Apr;13(2):99-110.

PMID: 23444871

Murrell Wayne, Palmero Emily, Bianco John, Stangeland Biljana, Joel Mrinal, Paulson Linda, Thiede Bernd, Grieg Zanina, Ramsnes Ingunn, Skjellegrind Håvard K, Nygård Ståle, Brandal Petter, Sandberg Cecilie, Vik-Mo Einar, Palmero Sheryl, Langmoen Iver A

Expansion of multipotent stem cells from the adult human brain.

PLoS One 2013;8(8):e71334. Epub 2013 aug 14

PMID: 23967194

Vik-Mo Einar Osland, Nyakas Marta, Mikkelsen Birthe Viftrup, Moe Morten Carstens, Due-Tønnesen Paulina, Suso Else Marit Inderberg, Sæbøe-Larssen Stein, Sandberg Cecilie, Brinchmann Jan E, Helseth Eirik, Rasmussen Anne-Marie, Lote Knut, Aamdal Steinar, Gaudernack Gustav, Kvalheim Gunnar, Langmoen Iver A

Therapeutic vaccination against autologous cancer stem cells with mRNA-transfected dendritic cells in patients with glioblastoma.

Cancer Immunol Immunother 2013 Sep;62(9):1499-509. Epub 2013 jul 2

PMID: 23817721

Sandberg Cecilie Jonsgar, Altschuler Gabriel, Jeong Jieun, Strømme Kirsten Kierulf, Stangeland Biljana, Murrell Wayne, Grasmo-Wendler Unn-Hilde, Myklebost Ola, Helseth Eirik, Vik-Mo Einar Osland, Hide Winston, Langmoen Iver A

Comparison of glioma stem cells to neural stem cells from the adult human brain identifies dysregulated Wnt- signaling and a fingerprint associated with clinical outcome.

Exp Cell Res 2013 Aug 15;319(14):2230-43. Epub 2013 jun 18

PMID: 23791939

Smeland Knut Bjøro, Kiserud Cecilie E, Lauritzsen Grete F, Fosså Alexander, Hammerstrøm Jens, Jetne Vidar, Kolstad Arne, Kvalheim Gunnar, Loge Jon Håvard, Løkeland Turid, Tangen Jon Magnus, Holte Harald, Kvaløy Stein

High-dose therapy with autologous stem cell support for lymphoma--from experimental to standard treatment.

Tidsskr Nor Laegeforen 2013 Sep 3;133(16):1735-9.

PMID: 24005713

Wang Ping, Suo Zhenhe, Wang Mengyu, Høifødt Hanne K, Fodstad Oystein, Gaudernack Gustav, Kvalheim Gunnar

In vitro and in vivo properties of CD133 expressing cells from human lung cancer cell lines.

Exp Hematol Oncol 2013;2(1):16. Epub 2013 jun 6

PMID: 23738757

Kaur Kiranpreet, Mirlashari Mohammad Reza, Kvalheim Gunnar, Kjeldsen-Kragh Jens

3',4'-Dimethoxyflavone and valproic acid promotes the proliferation of human hematopoietic stem cells.

Stem Cell Res Ther 2013 May 24;4(3):60. Epub 2013 mai 24

PMID: 23706670

Liu Yishan, Wu Xueping, Li Xiaoran, Kvalheim Gunnar, Axcrona Ulrika, Axcrona Karol, Suo Zhenhe

Blocking mtDNA replication upregulates the expression of stemness-related genes in prostate cancer cell lines.

Ultrastruct Pathol 2013 Aug;37(4):258-66. Epub 2013 mai 1

PMID: 23634795

Wang Ping, Gao Quanli, Suo Zhenhe, Munthe Else, Solberg Steinar, Ma LiWei, Wang Mengyu, Westerdaal Nomdo Anton Christiaan, Kvalheim Gunnar, Gaudernack Gustav

Identification and characterization of cells with cancer stem cell properties in human primary lung cancer cell lines.

PLoS One 2013;8(3):e57020. Epub 2013 mar 4

PMID: 23469181

Skårn Magne, Barøy Tale, Stratford Eva Wessel, Myklebost Ola

Epigenetic regulation and functional characterization of microRNA-142 in mesenchymal cells.

PLoS One 2013;8(11):e79231. Epub 2013 nov 13

PMID: 24236112

Behjati Sam, Tarpey Patrick S, Presneau Nadège, Scheipl Susanne, Pillay Nischalan, Van Loo Peter, Wedge David C, Cooke Susanna L, Gundem Gunes, Davies Helen, Nik-Zainal Serena, Martin Sancha, McLaren Stuart, Goodie Victoria, Robinson Ben, Butler Adam, Teague Jon W, Halai Dina, Khatri Bhavisha, Myklebost Ola, Baumhoer Daniel, Jundt Gernot, Hamoudi Rifat, Tirabosco Roberto, Amary M Fernanda, Futreal P Andrew, Stratton Michael R, Campbell Peter J, Flanagan Adrienne M

Distinct H3F3A and H3F3B driver mutations define chondroblastoma and giant cell tumor of bone.

Nat Genet 2013 Dec;45(12):1479-82. Epub 2013 okt 27

PMID: 24162739

Nome Torfinn, Thomassen Gard Os, Bruun Jarle, Ahlquist Terje, Bakken Anne C, Hoff Andreas M, Rognum Torleiv, Nesbakken Arild, Lorenz Susanne, Sun Jinchang, Barros-Silva João Diogo, Lind Guro E, Myklebost Ola, Teixeira Manuel R, Meza-Zepeda Leonardo A, Lothe Ragnhild A, Skotheim Rolf I

Common fusion transcripts identified in colorectal cancer cell lines by high-throughput RNA sequencing.

Transl Oncol 2013;6(5):546-53. Epub 2013 okt 1

PMID: 24151535

Lauvrak S U, Munthe E, Kresse S H, Stratford E W, Namløs H M, Meza-Zepeda L A, Myklebost O

Functional characterisation of osteosarcoma cell lines and identification of mRNAs and miRNAs associated with aggressive cancer phenotypes.

Br J Cancer 2013 Oct 15;109(8):2228-36. Epub 2013 sep 24

PMID: 24064976

Stratford Eva Wessel, Bostad Monica, Castro Russell, Skarpen Ellen, Berg Kristian, Høgset Anders, Myklebost Ola, Selbo Pål Kristian

Photochemical internalization of CD133-targeting immunotoxins efficiently depletes sarcoma cells with stem-like properties and reduces tumorigenicity.

Biochim Biophys Acta 2013 Aug;1830(8):4235-43. Epub 2013 mai 2

PMID: 23643966

Doorn Joyce, Fernandes Hugo A M, Le Bach Q, van de Peppel Jeroen, van Leeuwen Johannes P T M, De Vries Margreet R, Aref Zeen, Quax Paul H A, Myklebost Ola, Saris Daniel B F, van Blitterswijk Clemens A, de Boer Jan

A small molecule approach to engineering vascularized tissue.

Biomaterials 2013 Apr;34(12):3053-63. Epub 2013 jan 29

PMID: 23369216

Veréb Zoltán, Albert Réka, Póliska Szilárd, Olstad Ole Kristoffer, Akhtar Saeed, Moe Morten C, Petrovski Goran

Comparison of upstream regulators in human ex vivo cultured cornea limbal epithelial stem cells and differentiated corneal epithelial cells.

BMC Genomics 2013;14():900. Epub 2013 des 17

PMID: 24344983

Frøen Rebecca, Johnsen Erik O, Nicolaissen Bjørn, Facskó Andrea, Petrovski Goran, Moe Morten C

Does the adult human ciliary body epithelium contain "true" retinal stem cells?

Biomed Res Int 2013;2013():531579. Epub 2013 okt 28

PMID: 24286080

Boulland Jean-Luc, Leung Doreen S Y, Thuen Marte, Vik-Mo Einar, Joel Mrinal, Perreault Marie-Claude, Langmoen Iver A, Haraldseth Olav, Glover Joel C

Evaluation of intracellular labeling with micron-sized particles of iron oxide (MPIOs) as a general tool for in vitro and in vivo tracking of human stem and progenitor cells.

Cell Transplant 2012;21(8):1743-59. Epub 2012 mar 27

PMID: 22490338

Boulland Jean-Luc, Mastrangelopoulou Maria, Boquest Andrew C, Jakobsen Rune, Noer Agate, Glover Joel C, Collas Philippe

Epigenetic regulation of nestin expression during neurogenic differentiation of adipose tissue stem cells.

Stem Cells Dev 2013 Apr 1;22(7):1042-52. Epub 2012 des 21

PMID: 23140086

Langmoen Iver Arne, Foss Aksel, Kvalheim Gunnar, Engebretsen Lars, Glover Joel C

[In Process Citation].

Tidsskr Nor Laegeforen 2012 Dec;132(23):2584.

PMID: 23338066

Szöke Krisztina, Beckstrøm Karen Johanne, Brinchmann Jan E

Human adipose tissue as a source of cells with angiogenic potential.

Cell Transplant 2012;21(1):235-50. Epub 2011 jun 7

PMID: 21669039

Otto Beitnes Jan, Oie Erik, Shahdadfar Aboulghassem, Karlsen Tommy, Müller Regine M B, Aakhus Svend, Reinholt Finn P, Brinchmann Jan E

Intramyocardial injections of human mesenchymal stem cells following acute myocardial infarction modulate scar formation and improve left ventricular function.

Cell Transplant 2012;21(8):1697-709. Epub 2012 mar 8

PMID: 22410280

Szöke Krisztina, Beckstrøm Karen Johanne, Brinchmann Jan E

Ectopic expression of CDX4 in human mesenchymal stem cells does not affect HOX gene expression or induce hematopoietic reprogramming.

Stem Cell Res 2012 Sep;9(2):135-42. Epub 2012 mai 29

PMID: 22721648

Szöke Krisztina, Brinchmann Jan E

Concise review: therapeutic potential of adipose tissue-derived angiogenic cells.

Stem Cells Transl Med 2012 Sep;1(9):658-67. Epub 2012 sep 7

PMID: 23197872

Andersen Ingrid S, Ostrup Olga, Lindeman Leif C, Aanes Håvard, Reiner Andrew H, Mathavan Sinnakaruppan, Aleström Peter, Collas Philippe

Epigenetic complexity during the zebrafish mid-blastula transition.

Biochem Biophys Res Commun 2012 Jan;417(4):1139-44. Epub 2011 des 22

PMID: 22209792

Boquest Andrew C, Collas Philippe

Obtaining freshly isolated and cultured mesenchymal stem cells from human adipose tissue.

Methods Mol Biol 2012;879():269-78.

PMID: 22610564

Andersen Ingrid S, Reiner Andrew H, Aanes Håvard, Aleström Peter, Collas Philippe

Developmental features of DNA methylation during activation of the embryonic zebrafish genome.

Genome Biol 2012 Jul;13(7):R65. Epub 2012 jul 25

PMID: 22830626

Robertson Adam B, Dahl John Arne, Ougland Rune, Klungland Arne

Pull-down of 5-hydroxymethylcytosine DNA using JBP1-coated magnetic beads.

Nat Protoc 2012 Feb;7(2):340-50. Epub 2012 jan 26

PMID: 22281869

Calvo Jennifer A, Meira Lisiane B, Lee Chun-Yue I, Moroski-Erkul Catherine A, Abolhassani Nona, Taghizadeh Koli, Eichinger Lindsey W, Muthupalani Sureshkumar, Nordstrand Line M, Klungland Arne, Samson Leona D

DNA repair is indispensable for survival after acute inflammation.

J Clin Invest 2012 Jul;122(7):2680-9. Epub 2012 jun 11

PMID: 22684101

Kleppa Liv, Mari Pierre-Olivier, Larsen Elisabeth, Lien Guro Flor, Godon Camille, Theil Arjan F, Nesse Gaute J, Wiksen Hege, Vermeulen Wim, Giglia-Mari Giuseppina, Klungland Arne

Kinetics of endogenous mouse FEN1 in base excision repair.

Nucleic Acids Res 2012 Oct;40(18):9044-59. Epub 2012 jul 18

PMID: 22810208

Møllersen Linda, Rowe Alexander D, Illuzzi Jennifer L, Hildrestrand Gunn A, Gerhold Katharina J, Tveterås Linda, Bjølgerud Anja, Wilson David M, Bjørås Magnar, Klungland Arne

Neil1 is a genetic modifier of somatic and germline CAG trinucleotide repeat instability in R6/1 mice.

Hum Mol Genet 2012 Nov;21(22):4939-47. Epub 2012 aug 21

PMID: 22914735

Ougland Rune, Lando David, Jonson Ida, Dahl John A, Moen Marivi Nabong, Nordstrand Line M, Rognes Torbjørn, Lee Jeannie T, Klungland Arne, Kouzarides Tony, Larsen Elisabeth

ALKBH1 is a histone H2A dioxygenase involved in neural differentiation.

Stem Cells 2012 Dec;30(12):2672-82.

PMID: 22961808

Nordstrand Line M, Furu Kari, Paulsen Jonas, Rognes Torbjørn, Klungland Arne

Alkbh1 and Tzfp repress a non-repeat piRNA cluster in pachytene spermatocytes.

Nucleic Acids Res 2012 Nov;40(21):10950-63. Epub 2012 sep 10

PMID: 22965116

Chymkowitch Pierre, Eldholm Vegard, Lorenz Susanne, Zimmermann Christine, Lindvall Jessica M, Bjørås Magnar, Meza-Zepeda Leonardo A, Enserink Jorrit M

Cdc28 kinase activity regulates the basal transcription machinery at a subset of genes.

Proc Natl Acad Sci U S A 2012 Jun;109(26):10450-5. Epub 2012 jun 11

PMID: 22689984

Kinnunen Kati, Petrovski Goran, Moe Morten C, Berta András, Kaarniranta Kai

Molecular mechanisms of retinal pigment epithelium damage and development of age-related macular degeneration.

Acta Ophthalmol 2012 Jun;90(4):299-309. Epub 2011 nov 23

PMID: 22112056

Shahdadfar Aboulghassem, Haug Kristiane, Pathak Meeta, Drolsum Liv, Olstad Ole Kristoffer, Johnsen Erik O, Petrovski Goran, Moe Morten C, Nicolaissen Bjørn

Ex vivo expanded autologous limbal epithelial cells on amniotic membrane using a culture medium with human serum as single supplement.

Exp Eye Res 2012 Apr;97(1):1-9. Epub 2012 feb 7

PMID: 22342952

Haug Kristiane, Azqueta Amaya, Johnsen-Soriano Siv, Shahdadfar Aboulghassem, Drolsum Liv K, Moe Morten C, Røger Magnus T, Romero Francisco J, Collins Andrew R, Nicolaissen Bjørn

Donor cornea transfer from Optisol GS to organ culture storage: a two-step procedure to increase donor tissue lifespan.

Acta Ophthalmol 2012 Mar. Epub 2012 mar 16

PMID: 22429721

Johnsen Erik O, Frøen Rebecca C, Albert Réka, Omdal Bente K, Sarang Zsolt, Berta András, Nicolaissen Bjørn, Petrovski Goran, Moe Morten C

Activation of neural progenitor cells in human eyes with proliferative vitreoretinopathy.

Exp Eye Res 2012 May;98():28-36. Epub 2012 mar 21

PMID: 22465407

Ma Jin, Zhu Tie Pei, Moe Morten C, Ye Panpan, Yao Ke

Opticin production is reduced by hypoxia and VEGF in human retinal pigment epithelium via MMP-2 activation.

Cytokine 2012 Jul;59(1):100-7. Epub 2012 apr 24

PMID: 22534113

Johnsen-Soriano Siv, Haug Kristiane, Arnal Emma, Peris-Martinez Cristina, Moe Morten C, Romero Francisco Javier, Nicolaissen Bjørn

Oxidative stress gradient in a medium during human corneal organ culture.

Mol Vis 2012;18():1604-8. Epub 2012 jun 16

PMID: 22736949

Pathak Meeta, Cholidis Symira, Haug Kristiane, Shahdadfar Aboulghassem, Moe Morten C, Nicolaissen Bjørn, Drolsum Liv

Clinical transplantation of ex vivo expanded autologous limbal epithelial cells using a culture medium with human serum as single supplement: a retrospective case series.

Acta Ophthalmol 2013 Dec;91(8):769-75. Epub 2012 aug 31

PMID: 22937779

Øsnes-Ringen Oyvind, Azqueta Amaia O, Moe Morten C, Zetterström Charlotta, Røger Magnus, Nicolaissen Bjørn, Collins Andrew R

DNA damage in lens epithelium of cataract patients in vivo and ex vivo.

Acta Ophthalmol 2013 Nov;91(7):652-6. Epub 2012 sep 20

PMID: 22994213

Albert Réka, Veréb Zoltán, Csomós Krisztián, Moe Morten C, Johnsen Erik O, Olstad Ole Kristoffer, Nicolaissen Bjørn, Rajnavölgyi Eva, Fésüs László, Berta András, Petrovski Goran

Cultivation and characterization of cornea limbal epithelial stem cells on lens capsule in animal material-free medium.

PLoS One 2012;7(10):e47187. Epub 2012 okt 9

PMID: 23056608

Bøhn Siv K, Russnes Kjell M, Sakhi Amrit K, Thoresen Magne, Holden Marit, Moskaug Jan Ø, Myhrstad Mari C, Olstad Ole K, Smeland Sigbjørn, Blomhoff Rune

Stress associated gene expression in blood cells is related to outcome in radiotherapy treated head and neck cancer patients.

BMC Cancer 2012;12():426. Epub 2012 sep 25

PMID: 23009663

Kuijjer Marieke L, Rydbeck Halfdan, Kresse Stine H, Buddingh Emilie P, Lid Ana B, Roelofs Helene, Bürger Horst, Myklebost Ola, Hogendoorn Pancras C W, Meza-Zepeda Leonardo A, Cleton-Jansen Anne-Marie

Identification of osteosarcoma driver genes by integrative analysis of copy number and gene expression data.

Genes Chromosomes Cancer 2012 Jul;51(7):696-706. Epub 2012 mar 27

PMID: 22454324

Namløs Heidi M, Kresse Stine H, Müller Christoph R, Henriksen Jørn, Holdhus Rita, Sæter Gunnar, Bruland Oyvind S, Bjerkehagen Bodil, Steen Vidar M, Myklebost Ola

Global gene expression profiling of human osteosarcomas reveals metastasis-associated chemokine pattern.

Sarcoma 2012;2012():639038. Epub 2012 feb 28

PMID: 22518090

Stratford Eva W, Castro Russell, Daffinrud Jeanette, Skårn Magne, Lauvrak Silje, Munthe Else, Myklebost Ola

Characterization of liposarcoma cell lines for preclinical and biological studies.

Sarcoma 2012;2012():148614. Epub 2012 jul 14

PMID: 22911243

Namløs Heidi M, Meza-Zepeda Leonardo A, Barøy Tale, Østensen Ingrid H G, Kresse Stine H, Kuijjer Marieke L, Serra Massimo, Bürger Horst, Cleton-Jansen Anne-Marie, Myklebost Ola

Modulation of the osteosarcoma expression phenotype by microRNAs.

PLoS One 2012;7(10):e48086. Epub 2012 okt 25

PMID: 23133552

Kresse Stine H, Rydbeck Halfdan, Skårn Magne, Namløs Heidi M, Barragan-Polania Ana H, Cleton-Jansen Anne-Marie, Serra Massimo, Liestøl Knut, Hogendoorn Pancras C W, Hovig Eivind, Myklebost Ola, Meza-Zepeda Leonardo A

Integrative analysis reveals relationships of genetic and epigenetic alterations in osteosarcoma.

PLoS One 2012;7(11):e48262. Epub 2012 nov 7

PMID: 23144859

Skotheim Rolf I, Meza-Zepeda Leonardo A, Hovig Eivind, Lønning Per E, Lothe Ragnhild A, Myklebost Ola

[Genome sequencing for personalized cancer treatment].

Tidsskr Nor Laegeforen 2012 Nov;132(21):2406-8.

PMID: 23160594

Ma Yuanyuan, Liang Dongming, Liu Jian, Axcrona Karol, Kvalheim Gunnar, Giercksky Karl-Erik, Nesland Jahn M, Suo Zhenhe

Synergistic effect of SCF and G-CSF on stem-like properties in prostate cancer cell lines.

Tumour Biol 2012 Aug;33(4):967-78. Epub 2012 jan 18

PMID: 22252524

Fløisand Y, Brinch L, Gedde-Dahl T, Tjønnfjord G E, Dybedal I, Holte H, Heldal D, Torfoss D, Aurlien E, Lauritzsen G F, Fosså A, Lehne G, Baggerød E, Kvalheim G, Egeland T, Bishop M R, Fowler D H, Kolstad A

Ultra-short course sirolimus contributes to effective GVHD prophylaxis after reduced-intensity allogeneic hematopoietic cell transplantation.

Bone Marrow Transplant 2012 Dec;47(12):1552-7. Epub 2012 apr 23

PMID: 22522568

Pecquet Christian, Diaconu Carmen C, Staerk Judith, Girardot Michael, Marty Caroline, Royer Yohan, Defour Jean-Philippe, Dusa Alexandra, Besancenot Rodolphe, Giraudier Stephane, Villeval Jean-Luc, Knoops Laurent, Courtoy Pierre J, Vainchenker William, Constantinescu Stefan N

Thrombopoietin receptor down-modulation by JAK2 V617F: restoration of receptor levels by inhibitors of pathologic JAK2 signaling and of proteasomes.

Blood 2012 May;119(20):4625-35. Epub 2012 feb 29

PMID: 22378845

Glover JC

Stemming the scams

Public Service Review: European Science and Technology 15:208-209.

Glover JC, Krauss S

Fra science fiction til nobelpris.

Aftenposten, October 17, 2012

Langmoen IA, Foss A, Kvalheim G, Engebretsen L, Glover JC

Stamcelleforskning – nytt håp?

Tidsskr Nor Laegeforen.132:2584.

Doktorgrader
Magne Skårn

MicroRNAs in mesenchymal biology and differentiation

Disputert:
april 2014
Hovedveileder:
Ola Myklebost
Erik Otter Johnsen

Characterization of putative retinal stem cells in the adult human eye

Disputert:
juni 2014
Hovedveileder:
Morten Carstens Moe
Eivind Gard Lund

Lamin A-chromatin interactions characterized using high-throughput methods

Disputert:
oktober 2014
Hovedveileder:
Philippe Collas
Cecilie Jonsgar Sandberg

A Study of Stem Cells from Gliomas and Adult Human Brains - support for a clinical role of glioma stem cells

Disputert:
mars 2014
Hovedveileder:
Iver Arne Langmoen
Mrinal Joel

Characterization of stem cell-enriched glioblastoma cells in vitro and in xenotypic tissue environments

Disputert:
desember 2013
Hovedveileder:
Joel Glover
Sarah Roxana Herlofsen

Tissue engineering of hyaline cartilage. Genome-wide investigation of molecular mechanisms during in vitro chondrogenesis

Disputert:
september 2013
Hovedveileder:
Jan E. Brinchmann
Anja Solberg

Physiological Roles of Mouse Alkbh7: Implications in Obesity and Running Endurance

Disputert:
august 2013
Hovedveileder:
Arne Klungland
Tommy Aleksander Karlsen

In vitro chondrogenesis. The role of microRNAs during differentiation and dedifferentiation

Disputert:
juni 2013
Hovedveileder:
Jan E. Brinchmann
Jan Otto Beitnes

Cell therapy in acute myocardial infarction

Disputert:
februar 2012
Hovedveileder:
Jan Brinchmann
Marivi Nabong Moen

Mechanisms and structures in DNA base lesion repair

Disputert:
februar 2012
Hovedveileder:
Arne Klungland
Leif Christopher Lindeman

Mapping post-translational histone modifications during zygotic gene activation in zebrafish

Disputert:
mars 2012
Hovedveileder:
Philippe Collas
Rune Ougland

Role of the mammalian A1kB homologs 1 and 3 in RNA repair and epigenetic regulation of stem cell differentiation and development

Disputert:
mars 2012
Hovedveileder:
Arne Klungland
Ingrid Stavenes Andersen

Epigenetic regulation of zygotic gene activation in zebrafish

Disputert:
juni 2012
Hovedveileder:
Philippe Collas
Nedim Kasumacic

Functional organization of vestibulospinal inputs to spinal neurons involved in autonomic and motor control

Disputert:
juni 2012
Hovedveileder:
Joel Glover
Deltagere
  • Judith Staerk Forskningsgruppeleder
  • Gareth Sullivan Forskningsgruppeleder
  • Jan Øivind Moskaug Forskningsgruppeleder
  • Arne Klungland Forskningsgruppeleder
  • Magnar Bjørås Forskningsgruppeleder
  • Morten Carstens Moe Forskningsgruppeleder
  • Ola Myklebost Forskningsgruppeleder
  • Gunnar Kvalheim Forskningsgruppeleder
  • Iver Arne Langmoen Forskningsgruppeleder
  • Jan E. Brinchmann Forskningsgruppeleder
  • Philippe Collas Forskningsgruppeleder
  • Joel Glover Prosjektleder

eRapport er utarbeidet av Sølvi Lerfald og Reidar Thorstensen, Regionalt kompetansesenter for klinisk forskning, Helse Vest RHF, og videreutvikles av de fire RHF-ene i fellesskap, med støtte fra Helse Vest IKT

Alle henvendelser rettes til eRapport

Personvern  -  Informasjonskapsler