eRapport

Registerkoplinger

Prosjekt
Prosjektnummer
46013300
Ansvarlig person
Øystein Nytrø
Institusjon
NTNU, IE-fak.
Prosjektkategori
Forskningsinfrastruktur
Helsekategori
Generic Health Relevance
Forskningsaktivitet
1. Underpinning
Rapporter
2017 - sluttrapport
Økt kunnskap om a) Mulighet for pasientmodellbaserte identifikasjon av kliniske hendelser og uttrekk av lange individuelle pasientforløp b) Effekt av og krav til verktøy for å designe og vedlikeholde kliniske retningslinjer Praktiske krav til retningslinjeverktøy Anbefalinger og teknologi knyttet til infrastruktur for datadrevet individualisert helsetjeneste.

Forskningen bidrar til innovasojnsprosjektet BigMed.no, som vil realisere prototyper presis, individualisert diagnostikk og risikovurdering innen arvelige koronarsykdommer (HCM).

2016
Prosjektet videreutvikler metoder og programmer for maskinlæring av klassifikatorer for kliniske tekster og andre helsedata som finner og kopler hendelser i behandlingsprosesser og retningslinjer for behandling. Dette danner grunnlag for individualisert behandling på basis av analyser av store mengder strukturerte og ustrukturerte helsedata.Forskningsresultatene fra prosjektet Registerkoplinger, i form av verktøy, metodikk, programvare og publikasjoner, er blitt videreutviklet og har dannet en viktig basis i vellykkede NFR-støttede prosjekter. Bl.a. * "Evidence-based care processes: Integrating knowledge in clinical information systems" (NFR prosjektnummer 193022) og * "Keeping patients out of hospital by improving patient trajectories in primary care - methodological development and effect" (NFR prosjektnummer 213973) I løpet av 2016 er dette utviklet, testet og dokumentert videre slik at de er mer allment tilgjengelige og lettere gjenbrukbare. Gjennom bl.a. NFR IKTPluss-fyrtårnsprosjektet BIGMED, og pågående NFR- og H2020-søknader arbeider vi for å etablere en forskningsinfrastruktur for samstemming, samstilling, analyse og visualisering i heterogenere registerdata i Norge. Spesielt vil dette være en viktig forskningsinfrastruktur for å realisere individualisert helsehjelp i Helseplattformen. Vi har under fagfellevurdering nye teoretiske resultater og tilhørende verktøy og metoder innen to områder som er direkte relevant for etablering av en forskningsinfrastruktur basert på resultater fra Registerkoplinger: 1. Artikkel og verktøy: "Computational representation of events in individual patient trajectories: Handling distance." 2. Artikkel og verktøy: "Clinical process models improve detection of central venous catheter episodes in patient text narratives" Flere artikler som er finansiert av Registerkoplinger vil bli publisert i løpet av 2017. I 2017 vil to PhD-grader avsluttes innen området, og inntil tre eksternt finansierte Postdoc-stillinger utlyses.
2009
Prosjektet registerkoblinger knytter seg til aktiviteten ved EPJ-laboratoriet ved Institutt for datateknikk (IDI) og Norsk senter for elektronisk pasientjournal (NSEP). Her utvikles teknologi og metoder for å kunne trekke ut og presentere kunnskap om behandling og pasientforløp fra journaler og empiri.Elektroniske pasientjournaler (EPJ) innholder mange typer informasjon om pasienter. Dette inkluderer blant annet vitale tegn (kroppstemperatur, blodtrykk etc.), diagnostiske testresultater, funn fra kliniske undersøkelser og sosial- og familiebakgrunn. I tillegg finnes det informasjon om ulike prosedyrer ved behandlingsprosessen som er spesifikk for det stedet (f.eks. sykehuset) hvor pasienten befinner seg. Mengdene med informasjon som finnes i elektroniske pasientjournaler gir unike muligheter for klinisk forskning. Med metoder og teori fra IT finnes det blant annet muligheter for å sammenligne og validere informasjon om pasientbehandling, sykdomsforløp, og kommunikasjon i helsevesenet. Man kan også avdekke ikke-planlagte og avvikende hendelser i klinisk praksis, samt utvikle verktøy, begrepsapparater og systemer for beslutningsstøtte, datagruvedrift og forløpsanalyse. Denne typen forskning krever også at det utvikles metoder, teknikker og rutiner for å vaske, anonymisere, lagre og håndtere potensielt sensitiv informasjon. EPJ-laboratoriet forsker på teori, metodikk og verktøy for å kunne trekke ut og presentere slik kunnskap fra ustrukturert og heterogen klinisk informasjon. Aktiviteter i 2009: Mye arbeid ble lagt ned i å skrive en søknad til EUs FP7, området "Intelligent Information Management". Forslaget vi koordinerte, "HUGIN - The High Level Unifier of Ground Level Health Information", hadde som mål å utvikle spåk- og systemuavhengig teknologi og tilhørende infrastruktur for sanntids, interaktiv, spørring om og visualisering av pasientbehandling, behandlingsforløp og andre avanserte indikatorer som ligger gjemt i massive, heterogene samlinger av anonymisert helseinformasjon. NTNU var koordinator, med Rikshospitalet (OUS), Univ. Rennes (Frankrike), Hôpital Européen Georges Pompidou (Paris, Frankrike), Univ. Pavia (Italia), IFOMIS (Institute for Formal Ontology and Medical Information Science), Saarbrücken (Tyskland), Jozef Stefan Institute, Ljubljana and Custodix BV, Belgia som andre deltakere. EPJ-laboratoriet har blitt medlem av Hexanord, et forskningsnettverk finansiert av Nordforsk. HEXAnord er et nyetablert nettverk av aktører som er involvert i helsefag, informatikk og informasjonsteknologi i de nordiske og baltiske landene. Det overordnede målet for nettverket er å utforske forskjeller og likheter i teksten i elektroniske pasientjournaler i de ulike land ved hjelp av tekstgruvedrift. Et annet mål med nettverket er å styrke samarbeidet mellom de deltakende universitetene i de nordiske og baltiske landene. (http://dsv.su.se/forskning/ithalsa/projekt/hexanord) Vi har også brukt tid på kontakt mot I2B2 (Informatics for Integrating Biology & the Bedside, a National Center for Biomedical Computing) som er et prosjekt under ledelse av Partners Healthcare System og Harvard Medical School i USA. Øystein Nytrø tilbrakte 1 måned med støtte av TS Medisinsk Teknologi der i sommer. I2B2 avholder en internasjonal konkurranse ( www.i2b2.org/NLP/Medication/) innen analyse og uttrekk fra pasientjournaler. I år var utfordringen å automatisk hente medisineringsinformasjon fra fritekst i pasientjournaler. ERCIM-postdoc Saiful Akbar ledet arbeidet med oppgaven, og jobbet tett med stipendiat Thomas Brox Røst til å utvikle systemet vårt. Vi presenterte en artikkel i forbindelse med en workshop arrangert under American Medical Informatics Association (AMIA) konferansen i San Francisco. PhD Saiful Akbar har vært assosiert med prosjektet, og har arbeidet med i datagruvedrift og teknikker for maskinlæring . Han har hatt 1,5 års finansiering fra European Research Consortium for Informatics and Mathematics (ERCIM), IME-fakultetet og Institutt for datateknikk og informasjonsvitenskap (IDI). 3 MSc-studenter er tilknyttet laboratoriet, og 2 PhD-stillinger, finansiert av SO-midler og IDI, er under utlysning.
2008
Prosjektet registerkoblinger knytter seg til aktiviteten ved EPJ-laboratoriet hos Norsk senter for elektronisk pasientjournal (NSEP). Her genereres det kunnskap om behandling og pasientforløp fra journaler og empiri.Elektroniske pasientjournaler (EPJ) innholder mange typer informasjon om pasienter. Dette inkluderer blant annet vitale tegn (kroppstemperatur, blodtrykk etc.), diagnostiske testresultater, funn fra kliniske undersøkelser og sosial- og familiebakgrunn. I tillegg finnes det informasjon om ulike prosedyrer ved behandlingsprosessen som er spesifikk for det stedet (f.eks. sykehuset) hvor pasienten befinner seg. Mengdene med informasjon som finnes i elektroniske pasientjournaler gir unike muligheter for klinisk forskning. Med metoder og teori fra IT finnes det blant annet muligheter for å sammenligne og validere informasjon om pasientbehandling, sykdomsforløp, og kommunikasjon i helsevesenet. Man kan også avdekke ikke-planlagte og avvikende hendelser i klinisk praksis, samt utvikle verktøy, begrepsapparater og systemer for beslutningsstøtte, datagruvedrift og forløpsanalyse. Denne typen forskning stiller selvsagt også krav til at det utvikles metoder, teknikker og rutiner for å vaske, anonymisere, lagre og håndtere potensielt sensitiv informasjon. I 2008 har EPJ-laboratoriet fått satt i stand egne lokaler med tilgangsordning hos Norsk senter for elektronisk pasientjournal. Videre har Laura Slaughter blitt ansatt som forsker i en 3-årig stilling for å lede driften av laboratoriet. Slaughter har frem til nå blitt finansiert av strategiske midler fra NTNU, men medio 2009 vil prosjektet registerkoblinger ta over hennes lønnskostnader. En stor del av aktiviteten i 2008 har gått med til å utarbeide søknader for godkjenning av forskningsprosjekter. Disse er sendt til behandling hos Regional komité for medisinsk og helsefaglig forskningsetikk (REK Midt-Norge) og Norsk samfunnsvitensklig datatjeneste (NSD). I tillegg er det sendt søknad om dispensasjon fra taushetsplikten i forbindelse med forskning til Helsedirektoratet. Disse søknadsprosessene er forventet å pågå et godt stykke inn i 2009. I form av nettverksbygging kan det trekkes frem at flere av forskerne knytter til EPJ-laboratoriet deltok på årets Kvalitetsregisterkonferanse i Tromsø og HelsIT-konferanse i Trondheim. Målet for 2009 er i første omgang å få godkjent våre forskningsprosjekter hos REK og NSD. Deretter tar vi sikte på å publisere artikler innen områder som datagruvedrift, tekstgruvedrift, prosessanalyse, og ontologier. Vi vil også satse ytterligere på nettverksbygging og samarbeid med internasjonale miljø innen samme forskningsområde.
Vitenskapelige artikler
Khodambashi S, Nytrø Ø

Reviewing clinical guideline development tools: features and characteristics.

BMC Med Inform Decis Mak 2017 Sep 04;17(1):132. Epub 2017 sep 4

PMID: 28870182

Khodambashi S, Haugland D, Ellingsberg A, Kottum H, Sund JK, Nytrø Ø

An Experimental Comparison of a Co-Design Visualizing Personal Drug Information and Patient Information Leaflets: Usability Aspects.

Stud Health Technol Inform 2017;245():748-752.

PMID: 29295198

Khodambashi S, Nytrø Ø

A Systematic Literature Review on Evaluation of Digital Tools for Authoring Evidence-Based Clinical Guidelines.

Stud Health Technol Inform 2017;239():48-54.

PMID: 28756436

Eiring Ø, Nytrøen K, Kienlin S, Khodambashi S, Nylenna M

The development and feasibility of a personal health-optimization system for people with bipolar disorder.

BMC Med Inform Decis Mak 2017 Jul 10;17(1):102. Epub 2017 jul 10

PMID: 28693482

Khodambashi S, Gilstad H, Nytrø Ø

Usability Evaluation of Clinical Guidelines on the Web Using Eye-Tracker.

Stud Health Technol Inform 2016;228():95-9.

PMID: 27577349

Sørby Inger Dybdahl, Nytrø Oystein

Analysis of communicative behaviour: Profiling roles and activities.

Int J Med Inform 2009 Sep. Epub 2009 sep 16

PMID: 19766054

Seland Gry, Sørby Inger Dybdahl

Usability laboratory as the last outpost before implementation - lessons learnt from testing new patient record functionality.

Stud Health Technol Inform 2009;150():404-8.

PMID: 19745341

Karpati Peter, Toussaint Pieter Jelle, Nytrø Oystein

Computer-mediated mobile messaging as collaboration support for nurses.

Stud Health Technol Inform 2009;150():740-4.

PMID: 19745409

Bassøe Carl-Fredrik

Representing health, disorder and their transitions by digraphs.

Stud Health Technol Inform 2008;136():133-8.

PMID: 18487720

Brochhausen M, Slaughter L

Patient Empowerment by Ontology-Based Multi-lingual Systems

IFMBE Proceedings 25/XII, 439-42

Saiful Akbar, Thomas Brox Rust, Laura Slaughter, Øystein Nytrø.

Extracting Medication Information from Patient Discharge Summaries

Third i2b2 Shared-Task and Workshop Challenges in Natural Language Processing for Clinical Data Medication Extraction Challenge, 13 November, 2009, San Francisco

Doktorgrader
Soudabeh Khodambashi

Clinical Guideline Authoring Tools: Exploring Features and Requirements

Disputert:
desember 2017
Hovedveileder:
Øystein Nytrø
Deltagere
  • Soudabeh Khodambashi Doktorgradsstipendiat
  • Thomas Brox Røst Doktorgradsstipendiat

eRapport er utarbeidet av Sølvi Lerfald og Reidar Thorstensen, Regionalt kompetansesenter for klinisk forskning, Helse Vest RHF, og videreutvikles av de fire RHF-ene i fellesskap, med støtte fra Helse Vest IKT

Alle henvendelser rettes til Helse Midt-Norge RHF - Samarbeidsorganet og FFU

Personvern  -  Informasjonskapsler