Exploring the role of Hepatitis C virus infection on differentiation of liver stem cells: Effect on tumorigenic potential within infected liver

Vekselvirkninger mellom RNA virus og vertens immunresponsProsjektet har vært utført under et forskningsopphold ved Univ. of California, San Diego og er del av våre prosjekter som tar sikte på å forstå hvordan RNA virus vekselvirker med vertens immunsystem. Prosjektets målsetning er å identifisere komponenter som kan motvirke virusreplikasjon og sykdom.RNA virus inkluderer mange spesier som representerer globale helseproblemer, feks hepatitt C virus (HCV), humant immunsvikt virus (HIV), meslingevirus og influensavirus. Disse virusene bærer med seg proteiner og gener som vekselvirker med humane proteiner for å hindre cellulære prosesser, for eksempel immunresponser. For å identifisere cellulære faktorer som kan begrense replikasjon av HIV, har vi benyttet en såkalt system-biologisk tilnærming, hvor vi har samarbeidet med flere andre laboratorier. Studiene har involvert metoder innen funksjonell genomforskning, så som metoder for å nedregulere/fjerne etter tur alle gener i det humane arvemateriale, metoder for å finne humane proteiner som binder til HIV-proteiner, studier i immunceller, og studier for bestemmelse av DNA sekvenser i HIV-infiserte pasienter. Et initielt sk. helgenoms siRNA-mediert screen identifiserte 150 humane gener som hadde evnen til å redusere HIV-replikasjon og begrense den virale infeksjonen. For å bestemme om og i tilfelle hvordan disse genene påvirker det humane medfødte immunsystem har vi utført oppfølgingsstudier, hvor vi nedregulerte/fjernet disse ”restriksjonsfaktorene” og undersøkte effekten på immunresponsen. Som modellsystem for human medfødt immunrespons benyttet vi oss av såkalte Toll-liknende reseptorer (TLRs). TLRs er sensorer som finnes i humane celler og som kan binde til HIV virusets arvemateriale og dermed sette i gang immunresponser. Vi undersøkte først effekten av å nedregulere/fjerne humane proteiner på TLR-mediert aktivering av en bestemt aktivator av genuttrykk (transkripsjonsfaktoren NF-kB). Vi fant at ca 50% av de undersøkte genene som virket til å begrense HIV-infeksjon også virket i den medfødte immunresponsen. Vi har nå etablert en metode for å kunne studere effekten av disse 150 genene på flere aspekter av den medfødte immunresponsen ved såkalt RT-qPCR. Vi vil gjennomføre tilsvarende undersøkelser ved hjelp av dette og vil da finne effekten på flere relevante signalproteiner og det humane immunsystem. Det er forventet at prosjektet vil gi ny forståelse av hvordan HIV unngår og evt utnytter det humane immunsystem til sin fordel. Dette vil igjen kunne gi grunnlag for utvikling av nye terapeutiske strategier for behandling ved HIV infeksjoner.