eRapport

NATs - deres betydning for tumorigenese og utvikling av inhibitorer

Prosjekt
Prosjektnummer
911639
Ansvarlig person
Håvard Foyn
Institusjon
Helse Bergen HF
Prosjektkategori
Forskerutdanning - dr.grad
Helsekategori
Cancer
Forskningsaktivitet
5. Treatment Developement
Rapporter
2013 - sluttrapport
Med bakgrunn i undersøkelser av en vevsbank med skjoldkjerteltumorer på Haukeland Universitetssykehus, ble det identifisert et nytt gen som var oppregulert i tumorvev relativt til normalt vev i 2002. Videre undersøkelser viste at proteinet genet kodet for var en del av et enzymkompleks (NatA) som modifiserte nye proteiner idet de ble syntetisert. I tillegg viste det seg at fjerning av NatA hos kreftceller førte til celledød, nedsatt cellevekst og en økning i sensitivitet til kjemoterapi. Vi ønsket derfor i dette prosjektet å utvikle spesifikke hemmere mot NatA med tanke på kreftbehandling. Vi tror at hemming av NatA vil føre til tap av modifisering av enkelte nøkkelproteiner som igjen vil føre til celledød og nedsatt cellevekst. Vi tror også at slike hemmere kan være nyttige verktøy til å definere den nøyaktige mekanismen som ligger til grunn for de observerte effektene. Dette vil sette effektene i sammenheng med andre cellulære prosesser i kreftcellene noe som er viktig for å forstå NatA sin rolle i tumorigenese. Tidlig i dette prosjektet ble det gjort undersøkelser om hvilke proteiner som ble modifisert av NatA (Van Damme et. al., MCP, 2011) . Denne informasjonen ble så brukt til å designe og bisubstrat analoger til NatA som vil binde enzymet og hemme dens aktivitet. Et samarbeid med Paul Thompson ved The Scripps Research Institute i Florida ble innledet for å syntetisere disse hemmerene. Som en del av samarbeide var stipendiat Foyn gjesteforsker hos Thompsons lab i 2012 og fikk syntetisert en rekke hemmere. Hemmerene som ble syntetisert har blitt testet og viser ikke bare god hemmereffekt mot NatA in vitro. I tillegg viser forsøkene at hemmerene selektivt binder til og hemmer NatA, mens det har betydelig dårligere effekt mot andre lignende enzymer. Dette er viktig ettersom det er meget ønskelig med hemmere som kan gå inn i en celle og hemme akkurat NatA, mens det ikke påvirker andre komponenter i cellene. Dette er de aller første hemmerene av NatA og disse resultatene ble i fjor publisert i ACS chemical biology (Foyn et. al., ACS chem biol, 2013). Selv om denne stipend perioden er over, vil dette prosjektet fortsette. Ettersom resultatene har vært såpass lovende har vi startet neste fase, hvor vi videreutvikler disse hemmerene til å inneha celle permeable egenskaper. I tillegg til potensialet disse hemmerene har i forhold til kreftbehandling har disse hemmerene bidratt til å løse strukturen til NatA komplekset (Liszczak et. al., Nat Struct Mol Biol, 2013). Denne strukturen vil i fremtiden bli viktig for å utvikle enda bedre hemmere mot NatA. Målet til dette prosjektet var å utvikle hemmere til NatA. Og med støtten fra dette stipendet har de aller første hemmerene mot NatA blitt utviklet. Det gjenstår allikevel en del utvikling før dette får potensielle konsekvenser for helsetjenesten. Prosjektet vil bli videreført og vi håper at slike hemmere i fremtiden kan være et verdifullt verktøy i studien av NatA sin rolle i kreft i tillegg til en fremtidig rolle i bekjempelsen av kreft.
2012
NatA er et protein som er oppregulert i skjoldkjertelkreft. Undersøkelser viser at ved å fjerne NatA i kreftceller induseres celledød, nedsatt cellevekst og en økning i sensitivitet til kjemoterapi. Vi ønsker derfor i dette prosjektet å utvikle spesifikke hemmere med tanke på kreftbehandling.Med bakgrunn i undersøkelser av en vevsbank med skjoldkjerteltumorer på Haukeland Universitetssykehus, ble det identifisert et nytt gen som var oppregulert i tumorvev relativt til normalt vev i 2002. Videre undersøkelser viste at proteinet genet kodet for var en del av et enzymkompleks (NatA) som modifiserte nye proteiner idet de ble syntetisert. I tillegg viste det seg at fjerning av NatA hos kreftceller førte til celledød, nedsatt cellevekst og en økning i sensitivitet til kjemoterapi. Vi ønsker derfor i dette prosjektet å utvikle spesifikke hemmere mot NatA med tanke på kreftbehandling. Vi tror at hemming av NatA vil føre til tap av modifisering av enkelte nøkkelproteiner som igjen vil føre til celledød og nedsatt cellevekst. Vi tror også at slike hemmere kan være nyttige verktøy til å definere den nøyaktige mekanismen som ligger til grunn for de observerte effektene. Dette vil sette effektene i sammenheng med andre cellulære prosesser i kreftcellene noe som er viktig for å forstå NatA sin rolle i tumorigenese. Nylig ble det gjort undersøkelser som definerte hvilke proteiner som ble modifisert av NatA. Denne informasjonen ble brukt til å designe og syntetisere molekyler som ligner på målmolekylene til NatA, men som ikke vil la seg modifisere. For å kunne gjennomføre utviklingen av hemmerene innledet vi et samarbeid med Paul Thompson ved The Scripps Research Institute i Florida. Hans gruppe har lang erfaring med å syntetisere lignende hemmere for andre enzyme og som en del av samarbeidet var stipendiat Foyn gjesteforsker hos Thompsons lab i 2012. Vårt mål er først å utvikle spesifikke hemmere mot NatA som er effektive in vitro. Det vil si at de er effektive i et forenklet miljø utenfor cellen ettersom det er enklere å kontrollere. Deretter ønsker vi å utvikle spesifikke hemmere som kommer seg igjennom cellemembranen og kan hemme NatA inne i cellen, såkalte cellepermeable hemmere. Er dette steget vellykket vil studier i mus bli initiert. De første hemmerene som ble syntetisert har blitt testet og viser meget god hemmereffekt mot NatA in vitro. Og ikke bare det, forsøkene viser også at hemmerene selektivt binder til og hemmer NatA, mens det har betydelig dårligere effekt mot andre lignende enzymer. Dette er viktig ettersom det er meget ønskelig med hemmere som kan gå inn i en celle og hemme akkurat NatA, mens det ikke påvirker andre komponenter i cellene. Ettersom de preliminære resultatene har vært såpass lovende har vi satt i gang fase 2 hvor vi vil utvikle og teste ut cellepermeable hemmere.
2011
NatA er et protein som er oppregulert i skjoldkjertelkreft. Undersøkelser viser at ved å fjerne NatA i kreftceller induseres celledød, nedsatt cellevekst og en økning i sensitivitet til kjemoterapi. Vi ønsker derfor i dette prosjektet å utvikle spesifikke hemmere med tanke på kreftbehandling.Med bakgrunn i undersøkelser av en vevsbank med skjoldkerteltumorer på Haukeland Universitetssykehus, ble det identifisert et nytt gen som var oppregulert i tumorvev relativt til normalt vev i 2002. Videre undersøkelser viste at proteinet genet kodet for var en del av et enzymkompleks (NatA) som modifiserte nye proteiner idet de ble syntetisert. I tillegg viste det seg at fjerning av NatA hos kreftceller førte til celledød, nedsatt cellevekst og en økning i sensitivitet til kjemoterapi. Vi ønsker derfor i dette prosjektet å utvikle spesifikke hemmere mot NatA med tanke på kreftbehandling. Vi tror at hemming av NatA vil føre til tap av modifisering av enkelte nøkkelproteiner som igjen vil føre til celledød og nedsatt cellevekst. Vi tror også at slike hemmere kan være nyttige verktøy til å definere den nøyaktige mekanismen som ligger til grunn for de observerte effektene. Dette vil sette effektene i sammenheng med andre cellulære prosesser i kreftcellene noe som er viktig for å forstå NatA sin rolle i tumorigenese. Nylig ble det gjort undersøkelser som definerte hvilke proteiner som ble modifisert av NatA. Og denne informasjonen bruker vi til å designe molekyler som ligner på målmolekylene til NatA, men som ikke vil la seg modifisere. Dermed håper vi molekylene vil binde tett til og inaktivere NatA. Vårt mål er først å utvikle spesifikke hemmere mot NatA som er effektive in vitro. Det vil si at de er effektive i et forenklet miljø utenfor cellen ettersom det er enklere å kontrollere. Deretter ønsker vi å utvikle spesifikke hemmere som kommer seg igjennom cellemembranen og kan hemme NatA inne i cellen, såkalte cellepermeable hemmere. Er dette steget vellykket vil studier i mus bli initiert. For å kunne gjennomføre dette har vi innledet et samarbeid med Paul Thompson fra The Scripps Research Institute i Florida. Hans gruppe har lang erfaring med å syntetisere lignende hemmere for andre enzymer. Som en del av samarbeidet er stip. Foyn nå gjesteforsker ved scripps Paul Thompsons lab for å lære og for å syntetisere hemmere. De foreløpige resultatene har vist at de første hemmerene som er syntetisert har en meget god hemmereffekt mot NatA in vitro. Dette representerer de første NAT-hemmerne som er utviklet per i dag. Vi tror og håper derfor at vi innen kort tid kan sette i gang fase 2 hvor vi utvikler cellepermeable hemmere.
Vitenskapelige artikler
Foyn Håvard, Van Damme Petra, Støve Svein I, Glomnes Nina, Evjenth Rune, Gevaert Kris, Arnesen Thomas

Protein N-terminal acetyltransferases act as N-terminal propionyltransferases in vitro and in vivo.

Mol Cell Proteomics 2013 Jan;12(1):42-54. Epub 2012 okt 4

PMID: 23043182 - Inngår i doktorgradsavhandlingen

Foyn Håvard, Jones Justin E, Lewallen Dan, Narawane Rashmi, Varhaug Jan Erik, Thompson Paul R, Arnesen Thomas

Design, Synthesis, and Kinetic Characterization of Protein N-Terminal Acetyltransferase Inhibitors.

ACS Chem Biol 2013 Apr 4. Epub 2013 apr 4

PMID: 23557624 - Inngår i doktorgradsavhandlingen

Liszczak Glen, Goldberg Jacob M, Foyn Håvard, Petersson E James, Arnesen Thomas, Marmorstein Ronen

Molecular basis for N-terminal acetylation by the heterodimeric NatA complex.

Nat Struct Mol Biol 2013 Sep;20(9):1098-105. Epub 2013 aug 4

PMID: 23912279

Van Damme Petra, Evjenth Rune, Foyn Håvard, Demeyer Kimberly, De Bock Pieter-Jan, Lillehaug Johan R, Vandekerckhove Joël, Arnesen Thomas, Gevaert Kris

Proteome-derived peptide libraries allow detailed analysis of the substrate specificities of N(alpha)-acetyltransferases and point to hNaa10p as the post-translational actin N(alpha)-acetyltransferase.

Mol Cell Proteomics 2011 May;10(5):M110.004580. Epub 2011 mar 7

PMID: 21383206 - Inngår i doktorgradsavhandlingen

Doktorgrader
Håvard Foyn

N-terminal Acetyltransferases: Activity and Inhibition

Disputert:
august 2013
Hovedveileder:
Thomas Arnesen
Deltagere
  • Thomas Arnesen Hovedveileder
  • Håvard Foyn Ph.d.-kandidat

eRapport er utarbeidet av Sølvi Lerfald og Reidar Thorstensen, Regionalt kompetansesenter for klinisk forskning, Helse Vest RHF, og videreutvikles av de fire RHF-ene i fellesskap, med støtte fra Helse Vest IKT

Alle henvendelser rettes til Faglig rapportering, Helse Vest

Personvern  -  Informasjonskapsler