eRapport

Defekt N-terminal acetylering som årsak til sykdomsutvikling

Prosjekt
Prosjektnummer
911707
Ansvarlig person
Svein Isungset Støve
Institusjon
Helse Bergen HF
Prosjektkategori
Forskerutdanning - dr.grad
Helsekategori
Other
Forskningsaktivitet
1. Underpinning
Rapporter
2015 - sluttrapport
Ogden-syndrom er eit arvelig syndrom som fyrst blei oppdaga i to familiar i USA i 2011 (Rope A et al., Am J Hum Genet, 2011). Dette syndromet er forårsaka av ein mutasjon i NAA10 som sit på X-kromosomet, og rammar berre gutebarn. Gutar som blir ramma av Ogden-syndromet har mellom anna alvorleg utviklingshemming og dør før dei når ein alder på to år. I denne avhandlinga blir det forsøkt å forstå kvifor denne mutasjonen er dødelig hos menneske, ved å studere kva effekt denne mutasjonen har på eit molekylært og cellulært nivå. I tillegg til arbeidet med mutasjonen som forårsakar Ogden-syndromet, skildrar avhandlinga identifiseringa av fleire nye mutasjonar i NAA10 som har vorte oppdaga både hos gutar og jenter med utviklingshemming. NAA10 kodar for eit enzym som katalyserer ein kjemisk modifikasjon kalla N-terminal acetylering (Na-acetylering). Om lag 80% av alle protein i kroppen er Na-acetylerte. I motsetning til lysinacetylering (e-acetylering) er Na-acetylering av amingruppa på den første aminosyra i nysyntetiserte protein. Na-acetylering er irreversibel og skjer hovudsakelig ko-translasjonelt på ribosomet. Arbeidet presentert i denne avhandlinga viser mellom anna at Ogden syndrom varianten av Naa10 har redusert katalytisk aktivitet in vitro og redusert evne til å danne eit kompleks med interaksjonspartneren Naa15. Avhandlinga viser også at primærceller frå pasientar ramma av Ogden-syndromet både har veksthemming, redusert cellemigrasjon og eit redusert nivå av N-terminalt acetylerte protein. Prosjektet har over dei siste tre åra identifisert underliggande mekanismar ved dette syndromet, og viser for første gong at N-terminal acetylering er av stor tyding for normal fysiologi og sjukdom hos menneske. (Myklebust LM et al., Hum Mol Genet, 2015). I tillegg til arbeidet med å forstå underliggande mekanismar for Ogden syndromet har fleire nye tilfelle av barn med ulike kliniske manifestasjonar som skuldast NAA10-mutasjoner vorte identifisert. To av desse barna med psykisk utviklingshemming blei beskrive og funksjonelt undersøkt av forskarar i Erlangen-Nurnberg i samarbeid med oss på dette prosjektet her ved Kirurgisk klinikk HUS (Popp B et al., Eur J Hum Genet, 2015). I tillegg har me deltatt i samarbeid forskarar på Temple Street Children’s University Hospital (Dublin) som studerte eit brødrepar med psykisk utviklingshemming frå Irland med ein annan nylig oppdaga NAA10-mutasjon (Casey J et al., Sci Rep, 2015). Som eit direkte resultat av arbeidet i dette prosjektet har me også kome i kontakt med og arbeider saman med fleire samarbeidspartnarar både nasjonalt og internasjonalt som har pasientar med nyoppdaga NAA10 mutasjonar som ikkje har vorte omtala tidlegare. Prosjektet fokuserer på årsaksmekanismar bak eit arveleg dødeleg syndrom (Ogden sydrom). Ogden syndromet representerte den fyrste direkte koplinga mellom defekte N-terminal acetyltransferasar og human sjukdom. Sidan Ogden syndrom blei oppdaga i 2011 har eit relativt stort tal pasientar med ulike typar NAA10 mutasjonar vorte identifiserte både i Norge og i utlandet. Prosjektet har medverka til at me i dag har ei mykje betre forståing av korleis desse NAA10 mutasjonane fører til sjukdom i menneske, og kan vera til god hjelp for klinikarar og forskarar med pasientar ramma av NAA10 mutasjonar eller som oppdagar nye NAA10-mutasjonar i pasientar i framtida. Gjennom fleire nasjonale og internasjonale samarbeid har prosjektet også medverka i identifiseringa av nye pasientar med NAA10 mutasjonar, og til karakterisering av desse Naa10 variantane in vitro og in vivo.
2013
N-terminal (Nt-) acetylation is a covalent modification that occurs on the Nt-amino group of newly synthesized proteins, a modification catalyzed by a group of enzymes called N- terminal acetyltransferases (NATs). Despite the fact that over 80% of all eukaryotic soluble proteins are Nt-acetylated, the role of Nt-acetylation still remains elusive.Approximately 80-90% of all cytoplasmic proteins in human cells are Na-acetylated by a class of enzymes denoted N-terminal acetyltransferases (NATs). The NatA complex is composed of the catalytical subunit hNaa10p and the auxiliary subunit hNaa15p, as well as an additional catalytic subunit hNaa50p acetylating distinct NatE-type substrates. NatA is responsible for co-translational acetylation of proteins with Ser-, Ala-, Thr-, Gly-, and Val- N-termini, and in addition a role in post-translational acetylation of acidic Actin-N-termini was proposed. Recently, a previously undescribed X-linked infantile lethal disorder with several boys having died around one year of age was identified. X-chromosome exon sequencing and a recently developed probabilistic disease-gene discovery algorithm was used to identify a c.109T>C (p.Ser37Pro) variant in NAA10, the gene encoding the catalytic subunit of the human NatA complex. Structural modeling of the hNaa10p wild-type (WT) and mutated form (S37P) suggests a local shortening of an a-helix and reduced flexibility of a loop above the active site of S37P as compared to WT. In vitro functional analysis of hNaa10p-S37P revealed a 60-80 % reduction in NAT-activity towards specific substrates as compared to hNaa10p-WT. So far in this project, we have established a Saccharomyces cerevisiae model to study the in-vivo effects of the Naa10 S37P substitution. The yeast model was developed by introducing the human wild type or mutant NatA complex into yeast lacking NatA. This model revealed an in vivo functional impairment of the Ogden syndrome N-terminal acetyltransferase Naa10S37P mutant, and the findings from these experiments were recently published in the journal Molecular and cellular proteomics (Van Damme et al, 2014). To further characterize the functional effects of the S37P substitution on hNaa10p activity, we are using in vitro acetylation assays to determine steady-state kinetic constants of substrate-enzyme association, and are studying the effects of this mutation in primary fibroblast cell lines from an Ogden effected patient, and in control cell lines. Together, this will provide us with new insight in the functional effects of the S37P substitution, and bring us one step closer to understanding the molecular mechanism behind this inherative disease.
2012
Approximately 80-90% of all cytoplasmic proteins in human cells are Na-acetylated by a class of enzymes denoted N-terminal acetyltransferases (NATs). Recently, the first direct link between N-terminal acetylation and human disease was discovered.The NatA complex is composed of the catalytical subunit hNaa10p and the auxiliary subunit hNaa15p, as well as an additional catalytic subunit hNaa50p acetylating distinct NatE-type substrates. NatA is responsible for co-translational acetylation of proteins with Ser-, Ala-, Thr-, Gly-, and Val- N-termini, and in addition a role in post-translational acetylation of acidic Actin-N-termini was proposed. Recently, a previously undescribed X-linked infantile lethal disorder with several boys having died around one year of age was identified. X-chromosome exon sequencing and a recently developed probabilistic disease-gene discovery algorithm was used to identify a c.109T>C (p.Ser37Pro) variant in NAA10, the gene encoding the catalytic subunit of the human NatA complex. Structural modeling of the hNaa10p wild-type (WT) and mutated form (S37P) suggests a local shortening of an a-helix and reduced flexibility of a loop above the active site of S37P as compared to WT. In vitro functional analysis of hNaa10p-S37P revealed a 60-80 % reduction in NAT-activity towards specific substrates as compared to hNaa10p-WT. To further characterize the functional effects of the S37P substitution on hNaa10p activity, we are using in vitro acetylation assays to determine steady-state kinetic constants of substrate-enzyme association. This will provide us with new insight in the functional effects of the S37P substitution, and bring us one step closer to understanding the molecular mechanism behind this inherative disease.
Vitenskapelige artikler
Popp B, Støve SI, Endele S, Myklebust LM, Hoyer J, Sticht H, Azzarello-Burri S, Rauch A, Arnesen T, Reis A

De novo missense mutations in the NAA10 gene cause severe non-syndromic developmental delay in males and females.

Eur J Hum Genet 2015 May;23(5):602-9. Epub 2014 aug 6

PMID: 25099252 - Inngår i doktorgradsavhandlingen

Myklebust LM, Van Damme P, Støve SI, Dörfel MJ, Abboud A, Kalvik TV, Grauffel C, Jonckheere V, Wu Y, Swensen J, Kaasa H, Liszczak G, Marmorstein R, Reuter N, Lyon GJ, Gevaert K, Arnesen T

Biochemical and cellular analysis of Ogden syndrome reveals downstream Nt-acetylation defects.

Hum Mol Genet 2015 Apr 1;24(7):1956-76. Epub 2014 des 8

PMID: 25489052 - Inngår i doktorgradsavhandlingen

Aksnes H, Van Damme P, Goris M, Starheim KK, Marie M, Støve SI, Hoel C, Kalvik TV, Hole K, Glomnes N, Furnes C, Ljostveit S, Ziegler M, Niere M, Gevaert K, Arnesen T

An organellar na-acetyltransferase, naa60, acetylates cytosolic N termini of transmembrane proteins and maintains Golgi integrity.

Cell Rep 2015 Mar 3;10(8):1362-74. Epub 2015 feb 26

PMID: 25732826

Myklebust LM, Støve SI, Arnesen T

Naa10 in development and disease.

Oncotarget 2015 Oct 27;6(33):34041-2.

PMID: 26431279

Casey JP, Støve SI, McGorrian C, Galvin J, Blenski M, Dunne A, Ennis S, Brett F, King MD, Arnesen T, Lynch SA

NAA10 mutation causing a novel intellectual disability syndrome with Long QT due to N-terminal acetyltransferase impairment.

Sci Rep 2015;5():16022. Epub 2015 nov 2

PMID: 26522270

Doktorgrader
Svein Isungset Støve

Functional analysis of Na-acetyltransferase 10 (NAA10) variants identified in patients with genetic disorders

Disputert:
mars 2015
Hovedveileder:
Thomas Arnesen
Deltagere
  • Thomas Arnesen Leder av forskningsgruppe
  • Svein Isungset Støve Prosjektleder
  • Line Merethe Myklebust Postdoktor

eRapport er utarbeidet av Sølvi Lerfald og Reidar Thorstensen, Regionalt kompetansesenter for klinisk forskning, Helse Vest RHF, og videreutvikles av de fire RHF-ene i fellesskap, med støtte fra Helse Vest IKT

Alle henvendelser rettes til Faglig rapportering, Helse Vest

Personvern  -  Informasjonskapsler