eRapport

Identifisering av enzymer som regulerer kroppens metabolisme via hormonregulering

Prosjekt
Prosjektnummer
911761
Ansvarlig person
Camilla Osberg
Institusjon
Helse Bergen HF
Prosjektkategori
Forskerutdanning - dr.grad
Helsekategori
Other
Forskningsaktivitet
2. Aetiology
Rapporter
2016 - sluttrapport
HOVEDMÅL Sammendrag: Prosjektets hovedmål var å identifisere et eller flere N-terminal acetyltransferaser som er involvert i modifiseringen av peptid hormonene alfa-MSH og beta-endorfin. Ved hjelp av bisubstratanalogene nevnt i tidligere rapporter samt massespektrometriske analyser kom vi et skritt nærmere identifiseringen, men på grunn av tidsbegrensningen fikk vi ikke optimalisert metodene nok til at vi kan si med sikkerhet hvilke enzymer som acetylerer peptid hormonene. Derimot klarte vi å snevre inn antallet kandidater ved hjelp av lokaliseringsstudier med fluoresensmikroskopi samt å utvikle spesifikke antistoffer mot flere av kandidatene. I tillegg ble det generert cellelinjer hvor genet for de ulike kandidatene var individuelt slettet fra genomet ved hjelp av Crispr/Cas9 metoden. Disse cellelinjene ble blant annet brukt til testing av de spesifikke antistoffene mot kandidatene, men også testingen av antistoffene mot acetylert og uacetylert alfa-MSH og beta-endorfin. Vi testet også kandidatenzymene i ulike aktivitetsforsøk etter at de var blitt renset fra humane og musecellelinjer hvor de var blitt overuttrykt, men dette ga ingen positive utslag og metodene må optimaliseres videre. Ved hjelp av bisubstratanaloger har vi forsøkt å isolere enzymet/-ene fra ulike typer cellepreparater. Det gjenstår fremdeles å optimalisere metodene for denne delen av prosjektet. Dette inkluderer de massespektrometriske analysene som inngår (nytt instrument ble installert kort tid før prosjektet ble avsluttet). DELMÅL Sammendrag: Prosjektets to delmål var å studere enzymene i forhold til deres molekylære mekanismer, regulering og biologiske påvirkning samt å utvikle aktiverende/hemmende molekyler for enzymenes aktivitet. Begge delmålene ble adressert i løpet av perioden, men heller ikke her er resultatene klare. Noen av kandidatproteinene skiller seg mer ut som svært potensielle NAT enzymer med aktivitet mot enten alfa-MSH eller beta-endorfin. På grunn av dette ble planleggingen av NAT-hemmere startet i prosjektets sluttfase. Identifiseringen av NAT enzymet/-ene som acetylerer alfa-MSH og/eller beta-endorfin vil gi oss et viktig innblikk i hvordan kroppen styrer pigmentering, smerte og seksuell drift, reduserer inflammasjon og appetitt, samt øker regenereringen av nevroner og kroppens energiforbruk. Dette vil kunne komme til nytte for pasienter med en rekke ulike sykdommer når videre studier har belyst dette ytterligere.
2015
Vi ønsker i dette prosjektet å identifisere og karakterisere de enzymene som katalyserer N-terminal acetylering av alfa-MSH og beta-endorfin. Disse peptid-hormonene som styrer en rekke fysiologiske prosesser, slik som appetitt, metabolisme og smerte, er vist å være kritisk regulert av den N-terminale acetyleringen.Både alfa-MSH og beta-endorfin er peptidhormoner generert fra proopiomelanocortin (POMC). N-terminal acetylering av peptidene påvirker deres stabilitet og mulighet til å binde til reseptorer. Studier utført for omkring 30 år siden viser at N-terminal acetylering i den sekretoriske signalveien aktiverer alfa-MSH, mens beta-endorfin blir inaktivert. Dette gjør N-terminal acetylering til en sentral regulator av de fysiologiske funksjonene som utføres av alfa-MSH og beta-endorfin, slik som appetitt, metabolisme, inflammasjon og smerte. Identifisering og karakterisering av de enzymene (N-terminal acetyltransferaser - NATer) som modifiserer disse peptidhormonene vil kunne gi oss innsikt i hvordan kroppen regulerer disse fysiologiske prosessene. Dette vil igjen kunne gi oss nye angrepspunkter for behandling av sykdommer koblet til metabolske sykdommer, for eksempel overvekt. Dette prosjektet er godt i gang og vi arbeider parallelt med ulike tilnærminger. Det er blitt plukket ut flere enzymkandidater basert på søk i databaser og ulike sekvensanalyser. Foreløpig er de 10 mest attraktive kandidatene klonet inn i ulike ekspresjonssystemer og er under testing for aktivitet mot både alfa-MSH og beta-endorfin. Dette gjøres ved hjelp av ekspresjon i hypofyseceller og immunopresipitering (IP) av kandidater etterfulgt av en in vitro acetyleringsanalyse som gjøres ved kromatografisk undersøkelse (HPLC). Samtidig med dette studeres kandidatenes subcellulære lokalisering i spesifikke cellelinjer fra mus ved hjelp av immunofluorescens mikroskopi. I tillegg arbeider vi med å fraksjonere de samme cellene for å isolere sekretoriske vesikler. Målet med dette er å beholde enzymet aktivt og å få det til å binde til bisubstratanaloger. På den måten kan vi "fiske ut" enzymet og deretter utføre massespektrometri for å identifisere proteinet. I tillegg bruker vi radioimmunoassay (RIA) for å måle graden av acetylert peptidhormon. Nylig tok vi også i bruk ulike typer knock-out celler, der et av kandidat-genene er fjernet fra genomet, for å studere egenskaper hos disse cellene i forhold til de andre dataene vi har oppnådd i prosjektet.
2014
Vi ønsker i dette prosjektet å identifisere og karakterisere de enzymene som katalyserer N-terminal acetylering av alfa-MSH og beta-endorfin. Disse peptid-hormonene som styrer en rekke fysiologiske prosesser, slik som appetitt, metabolisme og smerte, er vist å være kritisk regulert av den N-terminale acetyleringen.Både alfa-MSH og beta-endorfin er peptidhormoner generert fra proopiomelanocortin (POMC). N-terminal acetylering av peptidene påvirker deres stabilitet og mulighet til å binde til reseptorer. Studier utført for omkring 30 år siden viser at N-terminal acetylering i den sekretoriske signalveien aktiverer alfa-MSH, mens beta-endorfin blir inaktivert. Dette gjør N-terminal acetylering til en sentral regulator av de fysiologiske funksjonene som utføres av alfa-MSH og beta-endorfin, slik som appetitt, metabolisme, inflammasjon og smerte. Identifisering og karakterisering av de enzymene (N-terminal acetyltransferaser - NATer) som modifiserer disse peptidhormonene vil kunne gi oss innsikt i hvordan kroppen regulerer disse fysiologiske prosessene. Dette vil igjen kunne gi oss nye angrepspunkter for behandling av sykdommer koblet til metabolske sykdommer, for eksempel overvekt. Dette PhD-prosjektet er godt i gang og vi arbeider parallelt med ulike tilnærminger. Det er blitt plukket ut flere enzymkandidater basert på søk i databaser og ulike sekvensanalyser. Foreløpig er de 10 mest attraktive kandidatene klonet inn i ulike ekspresjonssystemer og er under testing for aktivitet mot både alfa-MSH og beta-endorfin. Dette gjøres ved hjelp av ekspresjon i hypofyseceller og immunopresipitering (IP) av kandidater etterfulgt av en in vitro acetyleringsanalyse som gjøres ved kromatografisk undersøkelse (HPLC). Samtidig med dette studeres kandidatenes subcellulære lokalisering i spesifikke cellelinjer fra mus ved hjelp av immunofluorescens mikroskopi. I tillegg arbeider vi med å fraksjonere de samme cellene for å isolere sekretoriske vesikler. Målet med dette er å beholde enzymet aktivt og å få det til å binde til bisubstratanaloger. På den måten kan vi "fiske ut" enzymet og deretter utføre massespektrometri for å identifisere proteinet. I tillegg bruker vi radioimmunoassay (RIA) for å måle graden av acetylert peptidhormon.
2013
Vi ønsker i dette prosjektet å identifisere og karakterisere de enzymene som katalyserer N-terminal acetylering av alfa-MSH og beta-endorfin. Disse peptid-hormonene som styrer en rekke fysiologiske prosesser, slik som appetitt, metabolisme og smerte, er vist å være kritisk regulert av den N-terminale acetyleringen.Både alfa-MSH og beta-endorfin er peptid-hormoner generert fra proopiomelanocortin (POMC). N-terminal acetylering av peptidene påvirker deres stabilitet og mulighet til å binde til reseptorer. Studier utført for omkring 30 år siden viser at N-terminal acetylering i den sekretoriske signalveien aktiverer alfa-MSH, mens beta-endorfin blir inaktivert. Dette gjør N-terminal acetylering til en sentral regulator av de fysiologiske funksjonene som utføres av alfa-MSH og beta-endorfin, slik som appetitt, metabolisme, inflammasjon og smerte. Identifisering og karakterisering av de enzymene (N-terminal acetyltransferaser - NATer) som modifiserer disse peptid-hormonene vil kunne gi oss innsikt i hvordan kroppen regulerer disse fysiologiske prosessene. Dette vil igjen kunne gi oss nye angrepspunkter for behandling av sykdommer koblet til metabolske sykdommer, for eksempel overvekt. Dette PhD-prosjektet er i sin startfase og vi arbeider parallelt med ulike tilnærminger. Det er blitt plukket ut flere NAT-kandidater basert på søk i databaser og ulike sekvensanalyser. Foreløpig er de 10 mest attraktive kandidatene klonet inn i ulike ekspresjonssystemer og er under testing for aktivitet mot både alfa-MSH og beta-endorfin. Dette gjøres ved hjelp av ekspresjon i hypofyseceller og immunopresipitering (IP) av kandidater etterfulgt av en in vitro acetyleringsanalyse som gjøres ved kromatografisk undersøkelse (HPLC). Samtidig med dette studeres kandidatenes subcellulære lokalisering i spesifikke muse cellelinjer ved hjelp av immunofluorescens mikroskopi. I tillegg arbeider vi med å fraksjonere de samme cellene for å isolere sekretoriske vesikler. Målet med dette er å beholde enzymet aktivt og å få det til å binde til bisubstratanaloger. På den måten kan vi "fiske ut" enzymet og deretter utføre massespektrometri for å identifisere proteinet.
Vitenskapelige artikler
Osberg C, Aksnes H, Ninzima S, Marie M, Arnesen T

Microscopy-based Saccharomyces cerevisiae complementation model reveals functional conservation and redundancy of N-terminal acetyltransferases.

Sci Rep 2016 Aug 24;6():31627. Epub 2016 aug 24

PMID: 27555049 - Inngår i doktorgradsavhandlingen

Varland S, Osberg C, Arnesen T

N-terminal modifications of cellular proteins: The enzymes involved, their substrate specificities and biological effects.

Proteomics 2015 Jul;15(14):2385-401. Epub 2015 jun 16

PMID: 25914051 - Inngår i doktorgradsavhandlingen

Aksnes Henriette, Osberg Camilla, Arnesen Thomas

N-terminal acetylation by NatC is not a general determinant for substrate subcellular localization in Saccharomyces cerevisiae.

PLoS One 2013;8(4):e61012. Epub 2013 apr 15

PMID: 23613772 - Inngår i doktorgradsavhandlingen

Doktorgrader
Camilla Osberg

The protein N-terminal acetyltransferase C (NatC)

Disputert:
mai 2016
Hovedveileder:
Thomas Arnesen
Deltagere
  • Camilla Osberg Ph.d.-kandidat
  • Michael Bruno Eric Marie Medveileder
  • Henriette Aksnes Medveileder
  • Thomas Arnesen Hovedveileder

eRapport er utarbeidet av Sølvi Lerfald og Reidar Thorstensen, Regionalt kompetansesenter for klinisk forskning, Helse Vest RHF, og videreutvikles av de fire RHF-ene i fellesskap, med støtte fra Helse Vest IKT

Alle henvendelser rettes til Faglig rapportering, Helse Vest

Personvern  -  Informasjonskapsler