eRapport

Biomarkers and gene expression profiles for disease progression across different molecular subtypes of breast cancer

Prosjekt
Prosjektnummer
911869
Ansvarlig person
Elisabeth Wik
Institusjon
Helse Bergen HF
Prosjektkategori
Postdoktorstipend
Helsekategori
Cancer
Forskningsaktivitet
4. Detection and Diagnosis
Rapporter
2018 - sluttrapport
FORSKNING: Studier hovedsakelig innen brystkreft, ved lokale, nasjonale og internasjonale samarbeid. En del samarbeidende studier innen gynekologisk kreft. Jeg har vært biveileder for 5 PhD-kandidater (3 fullført PhD; 2 under arbeid), har rekruttert og hovedveiledet en forskerlinjestudent og en kandidat i pre-PhD studier (tildelt PhD-stipend januar 2019). Egne hovedprosjekter er i avsluttende fase før publikasjon. I postdoc-arbeidene er det fokusert på prognostiske biomarkører ved brystkreft, med eksplorerende arbeid opp mot bakenforliggende biologiske forandringer (se publikasjonsliste). I postdoc-prosjektet er det ellers etablert retrospektivt samlet kohort av unge brystkreftpasienter, med opparbeidelse av basline-data, som del av forskerlinjeprosjekt. Det forventes mye forskningsaktivitet i årene fremover med utgangspunkt i denne kohorten. Det er initiert samarbeid nasjonalt, også med utgangspunkt i arbeidet med unge brystkreftpasienter. FORMIDLING: I tillegg til de vitenskapelige publikasjonene i internasjonale tidsskrifter, har jeg publisert to bokkapitler: * What is a good (enough) biomarker? A. Blanchard & E. Wik. Book chapter i boken Social, ethical and economic aspects of cancer biomarkers. Editors: Anne Blanchard & Roger Strand (Megaloceros Press, 2017) * Gene Expression Signatures of the Tumor Microenvironment: Relation to Tumor Progress in Breast Cancer. E Wik & LA Akslen. Book Chapter in “Biomarkers of the Tumor Microenvironment” (Editors: LA Akslen R Watnick, Springer Verlag, 2017) Det er også skrevet populærvitenskapelig artikkel: «Biomarkører i kreftforskningen - fra mikroskop til ny medisin», populærvitenskapelig artikkel, Athene 2017 (Brystkreftforeningen’s magasin) * Det er ellers gitt en rekke presentasjoner ved vitenskapelige konferanser og møter UNDERVISNING: Jeg har deltatt i utvikling av CCBIO-HARVARD INTPART programmet, hvor det er etablert utvekslingsprogram mellom HUS/UiB og Vascular Biology Program, Harvard Medical School, og satt opp flere PhD-kurs og seminarer. Ellers veiledning av fem medisinerstudenter i særoppgave. En av de samarbeidende studiene (Aziz et al) har vært medvirkede til at retningslinjer for håndtering av brystkreft ble endret i Norge i 2017.
2017
En søker å gi individbasert behandling til kreftpasienter og på den måten unngå både overbehandling, med bivirkninger uten effekt, og under-/feilbehandling. En vil studere prognostiske og potensielle prediktive biomarkører, for å kunne bidra til forbedret individualisert behandling.Komplekse biomarkører (signaturer) anses å kunne fange opp større biologisk diversitet enn enkeltmarkører i en kreftsvulst. Vi eksplorerer genekspresjon-signaturer samt nettverksmoduler av kombinerte gen-data, for å forsøke å identifisere god og robuste prognostiske markører samt peke på potensielle behandlingsmål, spesielt i gruppen av basal-like brystkreft. I den første perioden av prosjektet er det jobbet frem REK-søknad (for både retrospektiv (1996-2014) og prospektiv serie (2015-2035); godkjent i REK Vest 2015. Videre er det prosessert dataserier av ulike gendata, for analyser inn mot eget postdoc-prosjekt og for parallelle, samarbeidende prosjekter i forskningsgruppen. Det er også etablert datamateriale med vev og klinisk-patologiske data samt informasjon om oppfølging på en serie av unge brystkreftpasienter. Flere arbeider er under arbeid knyttet til dette materialet, og en forskerlinjestudent er under hovedveileding av undertegnede og arbeider med dette som hovedprosjekt. En er også i tidlig fase for å etablere internasjonale samarbeid knyttet opp til disse arbeidene. Komplekse biomarkører (signaturer) anses å kunne fange opp større biologisk diversitet enn enkeltmarkører i en kreftsvulst. Vi eksplorerer genekspresjon-signaturer samt nettverksmoduler av kombinerte gen-data, for å forsøke å identifisere god og robuste prognostiske markører samt peke på potensielle behandlingsmål, spesielt i gruppen av basal-like brystkreft. I den første perioden av prosjektet er det jobbet frem REK-søknad (for både retrospektiv (1996-2014) og prospektiv serie (2015-2035); godkjent i REK Vest 2015. Videre er det prosessert dataserier av ulike gendata, for analyser inn mot eget postdoc-prosjekt og for parallelle, samarbeidende prosjekter i forskningsgruppen. Det er også etablert datamateriale med vev og klinisk-patologiske data samt informasjon om oppfølging på en serie av unge brystkreftpasienter. Flere arbeider er under arbeid knyttet til dette materialet, og en forskerlinjestudent er under hovedveileding av undertegnede og arbeider med dette som hovedprosjekt. En er også i tidlig fase for å etablere internasjonale samarbeid knyttet opp til disse arbeidene. En er i avsluttede fase med manus som beskriver forekomst av angioimmunogene prosesser i basaloid brystkreft. En er også i avsluttende arbeid med et manus der en har vist at nydannelse av kar og nerveutløpere (aksoner) viser økt samtidig forekomst ved enkelte subgrupper av brystkreft. Det er pulblisert to bokkapittel i to ulike bøker i 2017: Gene Expression Signatures of the Tumor Microenvironment: Relation to Tumor Progress in Breast Cancer (E. Wik & L.A. Akslen) i boken “Biomarkers of The Tumor Microenvironment”. Editors: Lars A. Akslen & Randolph S. Watnick (Springer Verlag, 2017) What is a good (enough) biomarker? (A. Blanchard & E. Wik) i boken “Social, ethical and economic aspects of cancer biomarkers”. Editors: Anne Blanchard & Roger Strand (Megaloceros Press, 2017) Det er ellers i prosjektet avsluttet to PhD-prosjekt i 2017 (Aziz og Krüger) og ytterligere en PhD avsluttes februar 2018 (Klingen). Undertegnede har i 2017, som medsøker med Lars Akslen, fått tilslag på søknad om Helse Vest forskningsmidler (flerårige midler), der flere av hypotesene og preliminære resultater fra dette postdoc-prosjektet er inkorporert.

Styrerepresetant i Kreftforeningen, avdeling Bergen, Anita Üstün, er brukerrepresentant. Hun er nylig tilkommet som dette, og vil være med på informasjonsmøter vedr prosjektet ila 2018, der en også vil drøfte evt utvidet brukermedvirkning i det videre prosjektarbeidet.

2016
Pasienter med ulike molekylære subtyper av brystkreft, slik definert per i dag, har behov for ulik behandling. Pasienter med basal-like subtype av brystkreft har aggressive svulster, ofte dårlig prognose, og er i dag uten et godt behandlingstilbud når langtkommen kreftsykdom foreligger.Komplekse biomarkører (signaturer) anses å kunne fange opp større biologisk diversitet enn enkeltmarkører i en kreftsvulst. Vi eksplorerer genekspresjon-signaturer samt nettverksmoduler av kombinerte gen-data, for å forsøke å identifisere god og robuste prognostiske markører samt peke på potensielle behandlingsmål, spesielt i gruppen av basal-like brystkreft. I den første perioden av prosjektet er det jobbet frem REK-søknad (for både retrospektiv (1996-2014) og prospektiv serie (2015-2035); godkjent i REK Vest 2015. Videre er det prosessert dataserier av ulike gendata, for analyser inn mot eget postdoc-prosjekt og for parallelle, samarbeidende prosjekter i forskningsgruppen. Det er også etablert datamateriale med vev og klinisk-patologiske data samt informasjon om oppfølging på en serie av unge brystkreftpasienter. Flere arbeider er under arbeid knyttet til dette materialet, og en forskerlinjestudent er under hovedveileding av undertegnede og arbeider med dette som hovedprosjekt. En er også i tidlig fase for å etablere internasjonale samarbeid knyttet opp til disse arbeidene. Preliminære resultater av DNA microarray genekspresjonsdata og RNA sekvenseingsdata har vist at kombinasjoner av genekspresjon-signaturer peker på tumorbiologiske prosesser i basal-like tumores, som vil studeres videre. En vil i det videre arbeidet også knytte opp andre nivåer av gen-data (mikro-RNA sekvensering, kopitallsanalyser og methyleringsdata) i form av nettverksanalyser, til de funn vi allerede har gjort. Validering av deler av funnene gjøres dels på gen-nivå, i separate valideringsserier, samt i form av immunhistokjemi og/eller in situ hybridisering av arkivert svulstmateriale. Det er ellers i prosjektet arbeidet mye inn mot andre PhD- og postdocprosjekter, med medforfatterskap på 18 publiserte arbeider siden oppstart av postdoc-prosjektet (2014-d.d.). Flere manus som førsteforfatter og som medforfatter er in progress/submitteres ila 2017.
2015
Bakgrunn: En søker å gi individbasert behandling til kreftpasienter og på den måten unngå både overbehandling, med bivirkninger uten effekt, og under-/feilbehandling. En vil studere prognostiske og potensielle prediktive biomarkører, for å kunne bidra til forbedret individualisert behandling.Pasienter med ulike molekylære subtyper av brystkreft, slik definert per i dag, har behov for ulik behandling. Pasienter med basal-like subtype av brystkreft har aggressive svulster, ofte dårlig prognose, og er i dag uten et godt behandlingstilbud når langtkommen kreftsykdom foreligger. Signaturer anses å kunne fange opp større biologisk diversitet enn enkeltmarkører i en kreftsvulst. Vi eksplorerer genekspresjon-signaturer samt nettverksmoduler av kombinerte gen-data, for å forsøke å identifisere god og robuste prognostiske markører samt peke på potensielle behandlingsmål, spesielt i gruppen av basal-like brystkreft. Fremdrift i postdoc-prosjektet i 2015: Endelig REK-godkjenning (for både retrospektiv (1996-2014) og prospektiv serie (2015-2035) i 2015. En har i 2015 arbeidet med planlegging og logistikk ifm oppstart av prospektiv biobank, inklusive innsamling av ferskt svulstvev. Planlagt startdato: 1. mars 2016. Videre er det gjennom 2015 opparbeidet ulike dataserier av gen-data, for analyser inn mot prosjektet og for parallelle, samarbeidende prosjekter i forskningsgruppen. Preliminære resultater av DNA microarray genekspresjonsdata og RNA sekvenseringsdata har vist at kombinasjoner av genekspresjon-signaturer peker på tumorbiologiske prosesser i basal-like tumores, som vil studeres videre. En vil i det videre arbeidet også knytte opp andre nivåer av gen-data (mikro-RNA sekvensering, kopitallsanalyser og methyleringsdata) i form av nettverksanalyser, til de funn vi allerede har gjort. Validering av deler av funnene gjøres dels på gen-nivå, i separate valideringsserier, samt i form av immunhistokjemi og/eller in situ hybridisering av arkivert svulstmateriale. I 2015 har undertegnede vært førsteforfatter av et bok-kapittel (Springer forlag) om gen-signaturer ved brystkreft (ikke publisert enda). Videre er 2 arbeider i manus-startfase. Det er ellers i 2015 gjort en del arbeid ifm medveiledning for 4 PhD-kandidater, hovedveiledning av en forskerlinjestudent og veiledning av en medisinerstudent med forskningspermisjon. Ifm forskerlinjestudentens prosjekt, er det arbeidet med opparbeiding av patologidata for ny pasientserie (del av REK-godkjenningen). Noe postdoc-tid er også gått med til undervisning (koordinerer et PhD-kurs, CCBIO-901, og har holdt flere enkeltforelesninger ved andre PhD-kurs ved UiB). Det er ellers i prosjektet arbeidet inn mot andre PhD- og postdocprosjekter lokalt, med medforfatterskap på 5 publiserte arbeider i 2015. Flere manus i samarbeid er submittert i siste nov-des 2015, og 12 manus fra samarbeidende prosjekter er "in progress".
2014
Bakgrunn: En søker å gi individbasert behandling til kreftpasienter og på den måten unngå både overbehandling, med bivirkninger uten effekt, og under-/feilbehandling. En vil studere prognostiske og potensielle prediktive biomarkører, for å kunne bidra til forbedret individualisert behandling.Biomarkører og genprofiler i ulike subtyper av brystkreft. Pasienter med ulike molekylære subtyper av brystkreft, slik definert per i dag, har behov for ulik behandling. Pasienter med basal-like subtype av brystkreft har aggressive svulster, ofte dårlig prognose, og er i dag uten et godt behandlingstilbud når langtkommen kreftsykdom foreligger. Signaturer anses å kunne fange opp større biologisk diversitet enn enkeltmarkører i en kreftsvulst. Vi eksplorerer genekspresjon-signaturer samt nettverksmoduler av kombinerte gen-data, for å forsøke å identifisere god og robuste prognostiske markører samt peke på potensielle behandlingsmål, spesielt i gruppen av basal-like brystkreft. I den første perioden av prosjektet er det jobbet frem REK-søknad (for både retrospektiv (1996-2014) og prospektiv serie (2015-2035); godkjent i REK Vest desember 2014, under forutsetning av tilsvar på et par mindre spørsmål). En har også prosessert dataserier av ulike gendata, for analyser inn mot prosjektet og for parallelle, samarbeidende prosjekter i forskningsgruppen. Preliminære resultater av DNA microarray genekspresjonsdata og RNA sekvenseingsdata har vist at kombinasjoner av genekspresjon-signaturer peker på tumorbiologiske prosesser i basal-like tumores, som vil studeres videre. En vil i det videre arbeidet også knytte opp andre nivåer av gen-data (mikro-RNA sekvensering, kopitallsanalyser og methyleringsdata) i form av nettverksanalyser, til de funn vi allerede har gjort. Validering av deler av funnene gjøres dels på gen-nivå, i separate valideringsserier, samt i form av immunhistokjemi og/eller in situ hybridisering av arkivert svulstmateriale. Det er ellers i prosjektet arbeidet mye inn mot andre PhD- og postdocprosjekter, med medforfatterskap på 10 publiserte arbeider i 2014, ett arbeid som første forfatter. Flere manus i samarbeid in progress/submitteres ila 2015.
Vitenskapelige artikler
Dimitrakopoulou K, Wik E, Akslen LA, Jonassen I

Deblender: a semi-/unsupervised multi-operational computational method for complete deconvolution of expression data from heterogeneous samples.

BMC Bioinformatics 2018 Nov 07;19(1):408. Epub 2018 nov 7

PMID: 30404611

Kusonmano K, Halle MK, Wik E, Hoivik EA, Krakstad C, Mauland KK, Tangen IL, Berg A, Werner HMJ, Trovik J, Øyan AM, Kalland KH, Jonassen I, Salvesen HB, Petersen K

Identification of highly connected and differentially expressed gene subnetworks in metastasizing endometrial cancer.

PLoS One 2018;13(11):e0206665. Epub 2018 nov 1

PMID: 30383835

Hanevik K, Wik E, Langeland N, Hausken T

Transient elevation of anti-transglutaminase and anti-endomysium antibodies in Giardia infection.

Scand J Gastroenterol 2018 Jun - Jul;53(7):809-812. Epub 2018 jun 16

PMID: 29911457

Klingen TA, Chen Y, Aas H, Wik E, Akslen LA

Tumor-associated macrophages are strongly related to vascular invasion, non-luminal subtypes, and interval breast cancer.

Hum Pathol 2017 11;69():72-80. Epub 2017 sep 18

PMID: 28923419

Landskron J, Kraggerud SM, Wik E, Dørum A, Bjørnslett M, Melum E, Helland Ø, Bjørge L, Lothe RA, Salvesen HB, Taskén K

C77G in PTPRC (CD45) is no risk allele for ovarian cancer, but associated with less aggressive disease.

PLoS One 2017;12(7):e0182030. Epub 2017 jul 31

PMID: 28759630

Krüger K, Wik E, Knutsvik G, Nalwoga H, Klingen TA, Arnes JB, Chen Y, Mannelqvist M, Dimitrakopoulou K, Stefansson IM, Birkeland E, Aas T, Tobin NP, Jonassen I, Bergh J, Foulkes WD, Akslen LA

Expression of Nestin associates with BRCA1 mutations, a basal-like phenotype and aggressive breast cancer.

Sci Rep 2017 Apr 24;7(1):1089. Epub 2017 apr 24

PMID: 28439082

Aziz S, Wik E, Knutsvik G, Klingen TA, Chen Y, Davidsen B, Aas H, Aas T, Akslen LA

Extra-nodal extension is a significant prognostic factor in lymph node positive breast cancer.

PLoS One 2017;12(2):e0171853. Epub 2017 feb 15

PMID: 28199370

Mauland KK, Wik E, Hoivik EA, Kusonmano K, Halle MK, Berg A, Haugland HK, Øyan AM, Kalland KH, Stefansson IM, Akslen LA, Krakstad C, Trovik J, Werner HM, Salvesen HB

Aneuploidy related transcriptional changes in endometrial cancer link low expression of chromosome 15q genes to poor survival.

Oncotarget 2017 Feb 07;8(6):9696-9707.

PMID: 28039471

Klingen TA, Chen Y, Stefansson IM, Knutsvik G, Collett K, Abrahamsen AL, Aase H, Aas H, Aas T, Wik E, Akslen LA

Tumour cell invasion into blood vessels is significantly related to breast cancer subtypes and decreased survival.

J Clin Pathol 2017 Apr;70(4):313-319. Epub 2016 sep 9

PMID: 27612505

Aziz S, Wik E, Knutsvik G, Klingen TA, Chen Y, Davidsen B, Aas H, Aas T, Akslen LA

Evaluation of Tumor Cell Proliferation by Ki-67 Expression and Mitotic Count in Lymph Node Metastases from Breast Cancer.

PLoS One 2016;11(3):e0150979. Epub 2016 mar 8

PMID: 26954367

Bartlett TE, Jones A, Goode EL, Fridley BL, Cunningham JM, Berns EM, Wik E, Salvesen HB, Davidson B, Trope CG, Lambrechts S, Vergote I, Widschwendter M

Intra-Gene DNA Methylation Variability Is a Clinically Independent Prognostic Marker in Women's Cancers.

PLoS One 2015;10(12):e0143178. Epub 2015 des 2

PMID: 26629914

Teschendorff AE, Lee SH, Jones A, Fiegl H, Kalwa M, Wagner W, Chindera K, Evans I, Dubeau L, Orjalo A, Horlings HM, Niederreiter L, Kaser A, Yang W, Goode EL, Fridley BL, Jenner RG, Berns EM, Wik E, Salvesen HB, Wisman GB, van der Zee AG, Davidson B, Trope CG, Lambrechts S, Vergote I, Calvert H, Jacobs IJ, Widschwendter M

HOTAIR and its surrogate DNA methylation signature indicate carboplatin resistance in ovarian cancer.

Genome Med 2015;7(1):108. Epub 2015 okt 24

PMID: 26497652

Bredholt G, Mannelqvist M, Stefansson IM, Birkeland E, Bø TH, Øyan AM, Trovik J, Kalland KH, Jonassen I, Salvesen HB, Wik E, Akslen LA

Tumor necrosis is an important hallmark of aggressive endometrial cancer and associates with hypoxia, angiogenesis and inflammation responses.

Oncotarget 2015 Nov 24;6(37):39676-91.

PMID: 26485755

Stefansson IM, Raeder M, Wik E, Mannelqvist M, Kusonmano K, Knutsvik G, Haldorsen I, Trovik J, Øyan AM, Kalland KH, Staff AC, Salvesen HB, Akslen LA

Increased angiogenesis is associated with a 32-gene expression signature and 6p21 amplification in aggressive endometrial cancer.

Oncotarget 2015 Apr 30;6(12):10634-45.

PMID: 25860936

Berg A, Hoivik EA, Mjøs S, Holst F, Werner HM, Tangen IL, Taylor-Weiner A, Gibson WJ, Kusonmano K, Wik E, Trovik J, Halle MK, Øyan AM, Kalland KH, Cherniack AD, Beroukhim R, Stefansson I, Mills GB, Krakstad C, Salvesen HB

Molecular profiling of endometrial carcinoma precursor, primary and metastatic lesions suggests different targets for treatment in obese compared to non-obese patients.

Oncotarget 2015 Jan 20;6(2):1327-39.

PMID: 25415225

Earp Madalene A, Kelemen Linda E, Magliocco Anthony M, Swenerton Kenneth D, Chenevix-Trench Georgia, Australian Cancer Study, Australian Ovarian Cancer Study Group, Lu Yi, Hein Alexander, Ekici Arif B, Beckmann Matthias W, Fasching Peter A, Lambrechts Diether, Despierre Evelyn, Vergote Ignace, Lambrechts Sandrina, Doherty Jennifer A, Rossing Mary Anne, Chang-Claude Jenny, Rudolph Anja, Friel Grace, Moysich Kirsten B, Odunsi Kunle, Sucheston-Campbell Lara, Lurie Galina, Goodman Marc T, Carney Michael E, Thompson Pamela J, Runnebaum Ingo B, Dürst Matthias, Hillemanns Peter, Dörk Thilo, Antonenkova Natalia, Bogdanova Natalia, Leminen Arto, Nevanlinna Heli, Pelttari Liisa M, Butzow Ralf, Bunker Clareann H, Modugno Francesmary, Edwards Robert P, Ness Roberta B, du Bois Andreas, Heitz Florian, Schwaab Ira, Harter Philipp, Karlan Beth Y, Walsh Christine, Lester Jenny, Jensen Allan, Kjær Susanne K, Høgdall Claus K, Høgdall Estrid, Lundvall Lene, Sellers Thomas A, Fridley Brooke L, Goode Ellen L, Cunningham Julie M, Vierkant Robert A, Giles Graham G, Baglietto Laura, Severi Gianluca, Southey Melissa C, Liang Dong, Wu Xifeng, Lu Karen, Hildebrandt Michelle A T, Levine Douglas A, Bisogna Maria, Schildkraut Joellen M, Iversen Edwin S, Weber Rachel Palmieri, Berchuck Andrew, Cramer Daniel W, Terry Kathryn L, Poole Elizabeth M, Tworoger Shelley S, Bandera Elisa V, Chandran Urmila, Orlow Irene, Olson Sara H, Wik Elisabeth, Salvesen Helga B, Bjorge Line, Halle Mari K, van Altena Anne M, Aben Katja K H, Kiemeney Lambertus A, Massuger Leon F A G, Pejovic Tanja, Bean Yukie T, Cybulski Cezary, Gronwald Jacek, Lubinski Jan, Wentzensen Nicolas, Brinton Louise A, Lissowska Jolanta, Garcia-Closas Montserrat, Dicks Ed, Dennis Joe, Easton Douglas F, Song Honglin, Tyrer Jonathan P, Pharoah Paul D P, Eccles Diana, Campbell Ian G, Whittemore Alice S, McGuire Valerie, Sieh Weiva, Rothstein Joseph H, Flanagan James M, Paul James, Brown Robert, Phelan Catherine M, Risch Harvey A, McLaughlin John R, Narod Steven A, Ziogas Argyrios, Anton-Culver Hoda, Gentry-Maharaj Aleksandra, Menon Usha, Gayther Simon A, Ramus Susan J, Wu Anna H, Pearce Celeste L, Pike Malcolm C, Dansonka-Mieszkowska Agnieszka, Rzepecka Iwona K, Szafron Lukasz M, Kupryjanczyk Jolanta, Cook Linda S, Le Nhu D, Brooks-Wilson Angela, Ovarian Cancer Association Consortium

Genome-wide association study of subtype-specific epithelial ovarian cancer risk alleles using pooled DNA.

Hum Genet 2014 May;133(5):481-97. Epub 2013 nov 5

PMID: 24190013

Charbonneau Bridget, Block Matthew S, Bamlet William R, Vierkant Robert A, Kalli Kimberly R, Fogarty Zachary, Rider David N, Sellers Thomas A, Tworoger Shelley S, Poole Elizabeth, Risch Harvey A, Salvesen Helga B, Kiemeney Lambertus A, Baglietto Laura, Giles Graham G, Severi Gianluca, Trabert Britton, Wentzensen Nicolas, Chenevix-Trench Georgia, for AOCS/ACS group, Whittemore Alice S, Sieh Weiva, Chang-Claude Jenny, Bandera Elisa V, Orlow Irene, Terry Kathryn, Goodman Marc T, Thompson Pamela J, Cook Linda S, Rossing Mary Anne, Ness Roberta B, Narod Steven A, Kupryjanczyk Jolanta, Lu Karen, Butzow Ralf, Dörk Thilo, Pejovic Tanja, Campbell Ian, Le Nhu D, Bunker Clareann H, Bogdanova Natalia, Runnebaum Ingo B, Eccles Diana, Paul James, Wu Anna H, Gayther Simon A, Hogdall Estrid, Heitz Florian, Kaye Stanley B, Karlan Beth Y, Anton-Culver Hoda, Gronwald Jacek, Hogdall Claus K, Lambrechts Diether, Fasching Peter A, Menon Usha, Schildkraut Joellen, Pearce Celeste Leigh, Levine Douglas A, Kjaer Susanne Kruger, Cramer Daniel, Flanagan James M, Phelan Catherine M, Brown Robert, Massuger Leon F A G, Song Honglin, Doherty Jennifer A, Krakstad Camilla, Liang Dong, Odunsi Kunle, Berchuck Andrew, Jensen Allan, Lubinski Jan, Nevanlinna Heli, Bean Yukie T, Lurie Galina, Ziogas Argyrios, Walsh Christine, Despierre Evelyn, Brinton Louise, Hein Alexander, Rudolph Anja, Dansonka-Mieszkowska Agnieszka, Olson Sara H, Harter Philipp, Tyrer Jonathan, Vitonis Allison F, Brooks-Wilson Angela, Aben Katja K, Pike Malcolm C, Ramus Susan J, Wik Elisabeth, Cybulski Cezary, Lin Jie, Sucheston Lara, Edwards Robert, McGuire Valerie, Lester Jenny, du Bois Andreas, Lundvall Lene, Wang-Gohrke Shan, Szafron Lukasz M, Lambrechts Sandrina, Yang Hannah, Beckmann Matthias W, Pelttari Liisa M, van Altena Anne M, Van Den Berg David, Halle Mari K, Gentry-Maharaj Aleksandra, Schwaab Ira, Chandran Urmila, Menkiszak Janusz, Ekici Arif B, Wilkens Lynne R, Leminen Arto, Modugno Francesmary, Friel Grace, Rothstein Joseph H, Vergote Ignace, Garcia-Closas Montserrat, Hildebrandt Michelle A T, Sobiczewski Piotr, Kelemen Linda E, Pharoah Paul D P, Moysich Kirsten, Knutson Keith L, Cunningham Julie M, Fridley Brooke L, Goode Ellen L

Risk of ovarian cancer and the NF-?B pathway: genetic association with IL1A and TNFSF10.

Cancer Res 2014 Feb 1;74(3):852-61. Epub 2013 nov 22

PMID: 24272484

Ojesina Akinyemi I, Lichtenstein Lee, Freeman Samuel S, Pedamallu Chandra Sekhar, Imaz-Rosshandler Ivan, Pugh Trevor J, Cherniack Andrew D, Ambrogio Lauren, Cibulskis Kristian, Bertelsen Bjørn, Romero-Cordoba Sandra, Treviño Victor, Vazquez-Santillan Karla, Guadarrama Alberto Salido, Wright Alexi A, Rosenberg Mara W, Duke Fujiko, Kaplan Bethany, Wang Rui, Nickerson Elizabeth, Walline Heather M, Lawrence Michael S, Stewart Chip, Carter Scott L, McKenna Aaron, Rodriguez-Sanchez Iram P, Espinosa-Castilla Magali, Woie Kathrine, Bjorge Line, Wik Elisabeth, Halle Mari K, Hoivik Erling A, Krakstad Camilla, Gabiño Nayeli Belem, Gómez-Macías Gabriela Sofia, Valdez-Chapa Lezmes D, Garza-Rodríguez María Lourdes, Maytorena German, Vazquez Jorge, Rodea Carlos, Cravioto Adrian, Cortes Maria L, Greulich Heidi, Crum Christopher P, Neuberg Donna S, Hidalgo-Miranda Alfredo, Escareno Claudia Rangel, Akslen Lars A, Carey Thomas E, Vintermyr Olav K, Gabriel Stacey B, Barrera-Saldaña Hugo A, Melendez-Zajgla Jorge, Getz Gad, Salvesen Helga B, Meyerson Matthew

Landscape of genomic alterations in cervical carcinomas.

Nature 2014 Feb 20;506(7488):371-5. Epub 2013 des 25

PMID: 24390348

Mauland Karen Klepsland, Wik Elisabeth, Salvesen Helga Birgitte

Clinical value of DNA content assessment in endometrial cancer.

Cytometry B Clin Cytom 2014 May;86(3):154-63. Epub 2014 feb 14

PMID: 24532190

Werner Henrica M J, Trovik Jone, Halle Mari K, Wik Elisabeth, Akslen Lars A, Birkeland Even, Bredholt Therese, Tangen Ingvild L, Krakstad Camilla, Salvesen Helga B

Stathmin protein level, a potential predictive marker for taxane treatment response in endometrial cancer.

PLoS One 2014;9(2):e90141. Epub 2014 feb 25

PMID: 24587245

Hoivik Erling A, Kusonmano Kanthida, Halle Mari K, Berg Anna, Wik Elisabeth, Werner Henrica M J, Petersen Kjell, Oyan Anne M, Kalland Karl-Henning, Krakstad Camilla, Trovik Jone, Widschwendter Martin, Salvesen Helga B

Hypomethylation of the CTCFL/BORIS promoter and aberrant expression during endometrial cancer progression suggests a role as an Epi-driver gene.

Oncotarget 2014 Feb 28;5(4):1052-61.

PMID: 24658009

Mannelqvist Monica, Wik Elisabeth, Stefansson Ingunn M, Akslen Lars A

An 18-gene signature for vascular invasion is associated with aggressive features and reduced survival in breast cancer.

PLoS One 2014;9(6):e98787. Epub 2014 jun 6

PMID: 24905342

Wik E, Trovik J, Kusonmano K, Birkeland E, Raeder M B, Pashtan I, Hoivik E A, Krakstad C, Werner H M J, Holst F, Mjøs S, Halle M K, Mannelqvist M, Mauland K K, Oyan A M, Stefansson I M, Petersen K, Simon R, Cherniack A D, Meyerson M, Kalland K H, Akslen L A, Salvesen H B

Endometrial Carcinoma Recurrence Score (ECARS) validates to identify aggressive disease and associates with markers of epithelial-mesenchymal transition and PI3K alterations.

Gynecol Oncol 2014 Sep;134(3):599-606. Epub 2014 jul 1

PMID: 24995579

Alonso-Alconada Lorena, Muinelo-Romay Laura, Madissoo Kadri, Diaz-Lopez Antonio, Krakstad Camilla, Trovik Jone, Wik Elisabeth, Hapangama Dharani, Coenegrachts Lieve, Cano Amparo, Gil-Moreno Antonio, Chiva Luis, Cueva Juan, Vieito Maria, Ortega Eugenia, Mariscal Javier, Colas Eva, Castellvi Josep, Cusido Maite, Dolcet Xavier, Nijman Hans W, Bosse Tjalling, Green John A, Romano Andrea, Reventos Jaume, Lopez-Lopez Rafael, Salvesen Helga B, Amant Frederic, Matias-Guiu Xavier, Moreno-Bueno Gema, Abal Miguel, ENITEC Consortium

Molecular profiling of circulating tumor cells links plasticity to the metastatic process in endometrial cancer.

Mol Cancer 2014;13():223. Epub 2014 sep 27

PMID: 25261936

Chen Ying, Klingen Tor A, Wik Elisabeth, Aas Hans, Vigeland Einar, Liestøl Knut, Garred Øystein, Mæhlen Jan, Akslen Lars A, Lømo Jon

Breast cancer stromal elastosis is associated with mammography screening detection, low Ki67 expression and favourable prognosis in a population-based study.

Diagn Pathol 2014 Dec 19;9(1):230. Epub 2014 des 19

PMID: 25522915

Doktorgrader
Tor Audun Klingen

Vascular invasion by tumor cells,and other prognostic factors in a population-based breast cancer study

Disputert:
februar 2018
Hovedveileder:
Lars A. Akslen
Sura Mohammed Aziz

Biological and clinico-pathologic markers in breast cancer

Disputert:
juni 2017
Hovedveileder:
Lars A. Akslen
Kristi Krüger

Markers of angiogenesis and basal-like phenotype of berast cancer

Disputert:
november 2017
Hovedveileder:
Lars A. Akslen
Deltagere
  • Amalie Abrahamsen Svanøe Prosjektdeltaker
  • Elisabeth Wik Postdoktor
  • Ying Chen Ph.d.-kandidat
  • Tor Audun Klingen Ph.d.-kandidat
  • Kristi Krüger Ph.d.-kandidat
  • Sura Mohammed Aziz Ph.d.-kandidat
  • Lars A. Akslen Prosjektleder

eRapport er utarbeidet av Sølvi Lerfald og Reidar Thorstensen, Regionalt kompetansesenter for klinisk forskning, Helse Vest RHF, og videreutvikles av de fire RHF-ene i fellesskap, med støtte fra Helse Vest IKT

Alle henvendelser rettes til Faglig rapportering, Helse Vest

Personvern  -  Informasjonskapsler