eRapport

Epimutations in MGMT and MLH1 and risk of cancers of the colon, endometrium and glioblastomas

Prosjekt
Prosjektnummer
F-12622
Ansvarlig person
Per Eystein Lønning
Institusjon
Helse Bergen HF
Prosjektkategori
Åpen prosjektstøtte
Helsekategori
Cancer
Forskningsaktivitet
2. Aetiology
Rapporter
2024
Prospektiv case-control studie som evaluerte effekten av MGMT promoter methylering i hvite blodlegemer på risikoen for utvikling av glioblastom, tykktarmskreft eller høygradig malignt storcellet lymfom hos kvinner. Studiens viste at MGMT promoter methylering ikke var assosiert med utvikling av inoen av disse kreftsykdommene.Vi har tidligere påvist at epimutasjoner i BRCA1 genet er assosiert med økt risiko for bryst / eggstokkreft. MGMT genet er hyppig epimutart i tykktarms- og hjernekreft, samt i enkelte typer av lymfomer. Sammen med den amerikanske Womens Health Initiative-studien har vi undersøkt om epimutasjoner i MGMT i blodprøver predikerer disse kreftformene. Funnet at epimutasjoner i BRCA1 genet i fosterlivet (Lønning JAMA Oncol 2022; Nikolaienko Genome Med 2023) gir opphav til trippel-negativ brysttkreft samt eggstokkreft viste en ny mekanisme for kreftutvikling, og det er nærliggende å anta at tilsvarende epimutasjoner i andre gener kan disponere for andre kreftsykdommer. BRCA1 studien ble gjort i samarbeid med den amerikanske Womens Health Initiative-studien (WHI). I studien over effekten av MGMT methylering nå har vi brukt et tilsvarende nested case-control design for å studere betydningen av epimutasjoner (promoter-methylering) hos friske kvinner for utvikling av tykktarms- og hjernekreft (glioblastomer) samt høygradig maligne lymfomer. Laboratorie-analysene og bioinformatikk på materialet ble gjort blindt; dvs vi kjennte ikke kodene (kreftpasient versus kontroll) før resultatene forelå. Labortorie-analysene ble ferdigstilt utpå våren 2024. Etter oversendelse av kvalitetskontroll-resultatene til WHI mottok vi ID-nøkkel (unblinding), og kunne foreta de statistiske analysene. Resultatene viste at methylering av MGMT i hvite blodceller ikke var prediktivt for risiko for noen av de tre kreftformene som ble undersøkt. I tillegg analyserte vi på betydning av variant-allelet av SNP rs16906252s opp mot krftrisiko. Dette allelet er tidligere vist (og bekreftet i vår studie) å være assosiert med økt risiko for MGMT promoter methylering. Også her var funnet negativt, i det tilstedeværelse av variant-allelet ikke predikerte for risiko for noen av kreftformene. Videre bekreftet omfattende sensitivitetsanalyser med hensyn på ulike områder av MGMT-promotoren de negative funnene. Selv om studien således kom ut med et negativt resultat har den stor betydning for vår videre forståelse av kreftrisiko samt betydningen av MGMT promoter methylering. Studiens unike design (blodprøver mange år før diagnose) sam statistiske styrke gjør at vi nå kan trekke sikre konklusjoner rundt MGMT genets betydning for kreftrisiko. Tross negativt funn er studien med sitt design funnet verdig for og akseptert for publikasjon i det anerkjente tidsskrifet Clinical Epigenetics, der den kommer på trykk i andre kvartal 2025.
2023
Vi har påvist at epimutasjoner i BRCA1 genet er assosiert med økt risiko for bryst / eggstokkreft. MGMT genet er hyppig epimutart i tykktarms- og hjernekreft, samt i enkelte typer av lymfomer. Sammen med den amerikanske Womens Health Initiative-studien undersøker vi om epimutasjoner i MGMT i blodprøver predikerer disse kreftformene.Funnet at epimutasjoner i BRCA1 genet i fosterlivet (Lønning JAMA Oncol 2022; Nikolaienko Genome Med 2023) gir opphav til trippel-negativ brsytkreft samt eggstokkreft viser en ny mekanisme for kreftutvikling, og det er nærliggende å ant t tilsvarende epimutasjoner i andre gener kan disponere for andre kreftsykdommer. BRCA1 studien ble gjort i samarbeid med den amerikanske Womens Health Initiative-studien (WHI). I studien nå bruker vi et tilsvarende nested case-control design for å studere betydningen av epimutasjoner (promoter-methylering) i et annet gen, MGMT, hos friske kvinner for utvikling av tykktarms- og hjernekreft (glioblastomer) samt høygradig maligne lymfomer. Studien er lagt opp som en nested case-control studie, der vi ser på risiko for kreftutvikling ut fra "hazard ratio"; HR. Laboratorie-analysene og bioinformatikk på materialet gjøres blindt; dvs vi kjenner ikke kodene (kreftpasient versus kontroll) før dette arbeide er gjort. Labortorie-analysene vil være ferdigstilt rundt midten av februar. Etter oversendelse av kvalitetskontroll-resultatene til WHI vil vi så motta ID-nøkkel, og resultatet av studien forventes klart rundt medio mars. I fall resultatet er positivt vil dette ha meget stor betydning for vår bredere forståelse av kreftutvikling. I fall det skulle vise seg negativt vil det, uansett, være en viktig observasjon, i det resultatet vil peke mot at prenatale epimutasjoner som de vi påviste i BRCA1 genet sannsynligvis er begrenset til noen meget få gen. I henhold til prosjektplan er det så langt ikke uttgått noen vitenskapelige arbeider fra prosjektet, i det disse først vil være aktuelle når selve resultatet av studien foreligger. Funnene vil deretter bli publisert enten de er postive eller negative.
2022
I 2022 rapporterte vi methylering i BRCA1 genet som årsak til incident bryst-samt eggstokkreft (Lønning et al; JAMA Oncol). Her ser vi på methylering i en annen tumorsuppressor, MGMT, som mulig årsak til kreft i andre organer. Samarbeidspartnere / study design (WHI / nested case-control) er tilsvarende BRCA1 studien.I 2022 har vi arbeidet ut alle formalia i samarbeid med the Womens Health Initiative (WHI) study og fått de siste formelle godkjenninger. Samtidig har vi finpusset analytisk metodikk i laboratoriet med hensyn på methyleringen av MGMT genet. Oppettet er klart, og vi forventer oversendelse av prøvene fra USA tidlig våren 2023 for umiddelbar oppstart av hovedanalysene i vårt laboratorium. Stdien går således etter planen; det har ikke inntrådt problemer / forsinkelser i forhold til opprinnelig studieplan. Ad tilleggsbevilgninger har gruppen for 2023 samt 2024 fortsatt status som KG Jebsen senter med tilhørende midler. prosjektet er i oppstartsfasen, og man forventer ikke publikasjoner påd ette tidspunkt.
Deltagere
  • Per Eystein Lønning Prosjektleder
  • Stian Knappskog Leder av forskningsgruppe
  • Oleksii Nikolaienko Prosjektdeltaker

eRapport er utarbeidet av Sølvi Lerfald og Reidar Thorstensen, Regionalt kompetansesenter for klinisk forskning, Helse Vest RHF, og videreutvikles av de fire RHF-ene i fellesskap, med støtte fra Helse Vest IKT

Alle henvendelser rettes til Faglig rapportering, Helse Vest

Personvern  -  Informasjonskapsler