Loader

Nasjonal kompetansetjeneste for påvisning av antibiotikaresistens

Nasjonal kompetansetjeneste innen fenotypiske og molekylære analyser for påvisning og karakterisering av antibiotikaresistente bakterier. Referansefunksjon for norske mikrobiologiske avdelinger.

Oppgaver og resultat
Kompetansesenteret (K-res) er en egen seksjon ved Avdeling for mikrobiologi og smittevern, UNN. K-res har siden oppstart i 2001-2 hatt fokus på nasjonal nettverksbygging og kompetansesperedning i forståelse med vårt oppdrag og tilbakemeldinger fra årlige evalueringsmøter med referansegruppen. Kompetansespredningen er primært rettet mot norske diagnostiske mikrobiologiske laboratorier (spesialisthelsetjenesten) gjennom et tett metodesamarbeid med Arbeidsgruppen for antibiotikaspørsmål (AFA)/Helsedirektoratet (Hdir) og etablering av nasjonale faglige retningslinjer, nasjonale nettverksstudier og publikasjoner med Norsk overvåkning av resistente mikrober (NORM)/Folkehelseinstituttet (FHI), samt ansvar for og deltakelse i nasjonale kurs for leger og bioingeniører, egne nyhetsbrev/webside, medforfatterskap i nasjonale antibiotikaveiledere, hospitering og veiledning av bioingeniører, leger under spesialisering og doktorgradskandidater i egen og andre helseregioner. K-res har følgende hovedoppgaver: (i) Påvisning og karakterisering av antibiotikaresistente bakterier som en referansefunksjon for norske mikrobiologiske avdelinger. (ii) Nasjonal kompetansespredning, kurs- og formidlingsvirksomhet om antibiotikaresistens. (iii) Forskning på et høyt internasjonalt nivå på utvalgte områder og i samarbeid med andre regionale fagmiljøer. AKTIVITET 2011 1. Referansefunksjon: Prøvevolum i 2011 (n=353) har økt siden 2010 (n=257), noe som hovedsakelig skyldes en økning i Gram-negative bakterier med spesielle resistensmekanismer, men også vankomycinresistente enterokokker og andre sporadiske resistensproblemer. 2. Nasjonal kompetansespredning gjennom: (a) Individuelle svar på referanseundersøkelser med tolkning og henvisning til relevant litteratur (n=353). (b) Egne elektroniske nyhets-/informasjonsskriv (n=13) med ~175 abonnenter nasjonalt. (c) Egne websider (www.unn.no/kres). (d) Foredrag på nasjonale konferanser. (e) Prosjektsamarbeid med norske laboratorier i nasjonale nettverksstudier og veiledning av doktorgradskandidater (Helse Vest, n=1/SørØst n=3). (f) Medarrangør av AFAs nasjonale kurs i resistensbestemmelse for norske laboratorier. (g) Sekretæriatsfunksjon for ivaretakelse av AFAs hjemmesider. (h) Vertskap for hospitering av bioingeniører, leger og forskere fra andre laboratorier. (i) Levering av kontroll/referansestammer for resistensbestemmelse til norske laboratorium også gjennom Ringtester utsendt av FHI. (j) Molekylære epidemiologiske analyser og skriftlige innlegg i NORM-rapporten. 3. Kurs og konferanseaktivitet: (i) Medarrangør av nasjonalt teoretisk og praktisk kurs i resistensbestemmelse arrangert av AFA med ca 45 deltakere. (ii) Deltatt i arrangementskomiteen for nordisk resistenskurs (NordicAST) i Gøteborg. (iii) Norsk representant i styret i Nordic Society of Clinical Microbiology and Infectious Disease. 4. Deltakelse i nasjonale arbeidsgrupper og komiteer: Medisinsk faglig leder ved K-res er leder for AFA og medlem av FHIs nasjonale antibiotikakomite. AFA utarbeider nasjonale retningslinjer/metoder for resistensbestemmelse. Flere av disse metodene har vært utarbeidet i nært samarbeid med K-res og basert på K-res initierte metodeevalueringer og forskningsprosjekter. Medlem av vitenskapelig rådgivende råd i Joint Programme Initiative on antimicrobial resistance i EU og har gjennom denne funksjonen dialog med HOD og FHI om norsk rolle og deltakelse. Bioingeniør ved K-res er medlem av rådgivende utvalg i mikrobiologi (Rufmik) i Bioingeniørfaglig institutt, Nito. Videre har K-res ansatte har vært medforfattere i utarbeidelse av nasjonale veiledere for bruk av antibiotika i primær- og spesialisthelsetjenesten. 5. Forskning: Forskningsaktiviteten har hovedfokus på molekylær epidemiologiske studier av klinisk viktige resistensmekanismer og evaluering/utprøving av diagnostiske tester for påvisning av antibiotikaresistens. Det henvises til publikasjonsliste for 2011 som illustrerer vårt nasjonale nettverk og samarbeid med andre helseregioner og pågående forskningsprosjekter med ekstern finansiering (EU, NFR og Helse Nord). Totalt var den vitenskapelige produksjonen meget solid for 2011. 6. Referansegruppe: K-res har siden 2002 hatt en faglig referansegruppe med representanter for alle helseregioner. De ga i sitt årlige novembermøte meget tilfredsstillende tilbakemeldinger på K-res faglige aktiviteter. Årsrapporten for 2011 gjennomgås av referansegruppen før den oversendes Departementet via Helse Nord.

Antibiotikaresistens er definert som et folkehelseproblem globalt og nasjonalt. Mikrobiologisk kompetanse er en forutsetning for korrekt diagnostikk og målrettet smittevern/terapi. K-res har i et mangeårig forsknings- og utviklingsarbeid opparbeidet et høyt internasjonalt nivå dokumentert ved eksterne evalueringer, publikasjoner, eksterne forskningsmidler, ansvar for nasjonale kurs i legers og bioingeniørers videre-/etterutdannelse, og deltakelse i nasjonalt planarbeid (Antibiotikakomiteen/FHI og AFA/Hdir). Samarbeidet med AFA gir grunnlag for nasjonale faglige retningslinjer og metoder. Gjennom nasjonale kurs og studiegrupper, referanseundersøkelser, nyhetsbrev og egne websider, foredrag og vitenskapelige arbeider arbeider K-res systematisk med nasjonal kompetansespredning. Dette er et dynamisk fagfelt som krever kontinuerlig oppdatering jfr foreslåtte endringer i MSIS fra 2012 med meldeplikt for bærerskap/infeksjoner med Gram-negative bakterier med spesielle resistensegenskaper.

Basis bevilgningen fra HOD har i 2011 finansiert 2 teknikerstillinger, 1 PhD-student (tidsbegrenset), 1 forsker (daglig leder) og en 20% overlegestilling (Professor i hovedstilling). Gjennom ekstern finanisering (NFR, Helse Nord og EU) og Universitetsavdelingen har det i 2011 i tillegg vært ansatt 2 prosjektingeniører, 2 PhD, 1 forsker og 2 postdoktorer. Forskningsprosjektene har en god balanse med seniorforskere og yngre kolleger. Rekruttering av fagpersonell har vært tilfredsstillende.

Aktivitet

Undervisning

Grunnutdanning av helsepersonell
4 timer
Etterutdanning av helsepersonell
37 timer

Formidling

Spesialisthelsetjenesten
  • Infeksjonsforum. (Konferanse).
Media
  • Flere kommentarer i norske medier knyttet til antibiotikaresistente bakterier. (Intervjuer/oppslag i media).

Kvalitetsverktøy

  • AFAs anbefalte metoder i resistenbestemmelser, samarbeid, 2011, Nasjonal retningslinje
  • AFAs kliniske brytningspunkter, samarbeid, 2011, Nasjonal retningslinje
Forskning

Vitenskapelige artikler

Karah Nabil, Giske Christian G, Sundsfjord Arnfinn, Samuelsen Orjan

A Diversity of OXA-Carbapenemases and Class 1 Integrons Among Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii Clinical Isolates from Sweden Belonging to Different International Clonal Lineages.

Microb Drug Resist 2011 Dec;17(4):545-9. Epub 2011 aug 10

PMID:
21830948
Sun J, Sundsfjord A, Song X

Enterococcus faecalis from patients with chronic periodontitis: virulence and antimicrobial resistance traits and determinants.

Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2011 Jun. Epub 2011 jun 10

PMID:
21660501
Borra Pardha Saradhi, Leiros Hanna-Kirsti S, Ahmad Rafi, Spencer James, Leiros Ingar, Walsh Timothy R, Sundsfjord Arnfinn, Samuelsen Orjan

Structural and computational investigations of VIM-7: insights into the substrate specificity of vim metallo-ß-lactamases.

J Mol Biol 2011 Aug;411(1):174-89. Epub 2011 mai 30

PMID:
21645522
Samuelsen Ø, Toleman M A, Hasseltvedt V, Fuursted K, Leegaard T M, Walsh T R, Sundsfjord A, Giske C G

Molecular characterization of VIM-producing Klebsiella pneumoniae from Scandinavia reveals genetic relatedness with international clonal complexes encoding transferable multidrug resistance.

Clin Microbiol Infect 2011 Dec;17(12):1811-6. Epub 2011 mai 20

PMID:
21595797
Bjørkeng Eva, Rasmussen Gunlög, Sundsfjord Arnfinn, Sjöberg Lennart, Hegstad Kristin, Söderquist Bo

Clustering of polyclonal VanB-type vancomycin-resistant Enterococcus faecium in a low-endemic area was associated with CC17-genogroup strains harbouring transferable vanB2-Tn5382 and pRUM-like repA containing plasmids with axe-txe plasmid addiction systems.

APMIS 2011 Apr;119(4-5):247-58. Epub 2011 feb 25

PMID:
21492224
Karah Nabil, Haldorsen Bjørg, Hegstad Kristin, Simonsen Gunnar Skov, Sundsfjord Arnfinn, Samuelsen Ørjan, PubMed.ItemsChoiceType2[]

Species identification and molecular characterization of Acinetobacter spp. blood culture isolates from Norway.

J Antimicrob Chemother 2011 Apr;66(4):738-44. Epub 2011 jan 19

PMID:
21393175
Naseer Umaer, Sundsfjord Arnfinn

The CTX-M conundrum: dissemination of plasmids and Escherichia coli clones.

Microb Drug Resist 2011 Mar;17(1):83-97. Epub 2011 jan 31

PMID:
21281129
Johnsen P J, Townsend J P, Bøhn T, Simonsen G S, Sundsfjord A, Nielsen K M

Retrospective evidence for a biological cost of vancomycin resistance determinants in the absence of glycopeptide selective pressures.

J Antimicrob Chemother 2011 Mar;66(3):608-10. Epub 2011 jan 7

PMID:
21217128
Tveten Yngvar, Sarjomaa Marjut Anneli, Skaare Dagfinn, Grude Nils, Samuelsen Ørjan

[How to stop multiresistant bacteria?].

Tidsskr Nor Laegeforen 2011 Apr;131(7):698-700.

PMID:
21494308
Seki Liliane M, Pereira Polyana S, de Souza Maria da Penha A H, Conceição Magda de S, Marques Elizabeth A, Porto Carlos Oliveira, Colnago Elvira Maria L, Alves Carlene de F M, Gomes Deize, Assef Ana Paula D A Carvalho, Samuelsen Ørjan, Asensi Marise D

Molecular epidemiology of KPC-2- producing Klebsiella pneumoniae isolates in Brazil: the predominance of sequence type 437.

Diagn Microbiol Infect Dis 2011 Jun;70(2):274-7. Epub 2011 mar 11

PMID:
21397425
Samuelsen Ørjan, Thilesen Carina M, Heggelund Lars, Vada Anne N, Kümmel Angela, Sundsfjord Arnfinn

Identification of NDM-1-producing Enterobacteriaceae in Norway.

J Antimicrob Chemother 2011 Mar;66(3):670-2. Epub 2010 des 16

PMID:
21172785
Karah Nabil, Haldorsen Bjørg, Hermansen Nils O, Tveten Yngvar, Ragnhildstveit Eivind, Skutlaberg Dag H, Tofteland Ståle, Sundsfjord Arnfinn, Samuelsen Ørjan

Emergence of OXA-carbapenemase- and 16S rRNA methylase-producing international clones of Acinetobacter baumannii in Norway.

J Med Microbiol 2011 Apr;60(Pt 4):515-21. Epub 2010 des 16

PMID:
21163830
Werner Guido, Freitas Ana R, Coque Teresa M, Sollid Johanna E, Lester Camilla, Hammerum Anette M, Garcia-Migura Lourdes, Jensen Lars B, Francia Maria V, Witte Wolfgang, Willems R J, Sundsfjord Arnfinn

Host range of enterococcal vanA plasmids among Gram-positive intestinal bacteria.

J Antimicrob Chemother 2011 Feb;66(2):273-82. Epub 2010 des 3

PMID:
21131318
Vading M, Samuelsen Ø, Haldorsen B, Sundsfjord A S, Giske C G

Comparison of disk diffusion, Etest and VITEK2 for detection of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae with the EUCAST and CLSI breakpoint systems.

Clin Microbiol Infect 2011 May;17(5):668-74.

PMID:
20649801
Giske C G, Gezelius L, Samuelsen Ø, Warner M, Sundsfjord A, Woodford N

A sensitive and specific phenotypic assay for detection of metallo-ß-lactamases and KPC in Klebsiella pneumoniae with the use of meropenem disks supplemented with aminophenylboronic acid, dipicolinic acid and cloxacillin.

Clin Microbiol Infect 2011 Apr;17(4):552-6.

PMID:
20597925
Saule M, Samuelsen Ø, Dumpis U, Sundsfjord A, Karlsone A, Balode A, Miklasevics E, Karah N

Molecular epidemiology of invasive carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii isolates from Latvia

51st Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Chigago, USA

Haldorsen B, Hegstad K, Simonsen GS, Sundsfjord A, Samuelsen Ø

The first report of the 16S rRNA methylases rmtB and rmtD in clinical Gram-negative bacteria in Norway

28th Annual meeting of the Scandinavian Society for Antimicrobial Chemotherapy, Reykjavik, Iceland

Wolden R, Haldorsen B, Sundsfjord A, Samuelsen Ø

Evaluation of ROSCO disks for the detection of increased AmpC expression in Escherichia coli

28th Annual meeting of the Scandinavian Society for Antimicrobial Chemotherapy, Reykjavik, Iceland

Karah N, Giske C, Sundsfjord A, Samuelsen Ø

OXA-carbapenemase-producing multidrug-resistant Acinetobacter baumannii isolates from Sweden

21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases/27th International Congress of Chemotherapy, Milan, Italy

Haldorsen B, Hegstad K, Simonsen GS, Sundsfjord A, Samuelsen Ø

Phenotypic and genotypic characterisation of aminoglycoside resistance in Norwegian clinical isolates of Escherichia coli and Kl

21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases/27th International Congress of Chemotherapy, Milan, Italy

Karah N, Smyth R, Haldorsen B, Sundsfjord A, Samuelsen Ø

Comparison of Vitek2, BD Phoenix, and MALDI-TOF for the identification of Acinetobacter species

21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases/27th International Congress of Chemotherapy, Milan, Italy

Pedersen T, Langnes B, Hegstad K, Rosvoll TC, Aasnæs A, Hammerum AM, Lester C, Simonsen GS, Sundsfjord A

Increased prevalence of high-level gentamicin resistance in invasive Enterococcus feacium strains in Norway is associated with h

21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases/27th International Congress of Chemotherapy, Milan, Italy

Sivertsen A, Lundblad EW, Wisell KT, Liljequist B, Billström H, Ullberg M, Heimer D, Sjögren I, Aasnæs B, Sundsfjord A, Hegstad K

The widespread VRE outbreak in Swedish hospitals 2007-2009 was associated with clonal E. faecium CC17 genogroup strains harbouri

21st European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases/27th International Congress of Chemotherapy, Milan, Italy

Langnes B, Sundsfjord A, Pedersen T

The ?-e-? and axe-txe toxin-antitoxin loci in Enterococcus faecium: expression and regulation studies

4th FEMS Congress of European Microbiologists, Geneva, Switzerland

Avlagte doktorgrader

Nabil Karah

Identification, molecular epidemiology, and antibiotic resistance characterization of Acinetobacter spp. clinical isolates

Disputert:
September 2011
Hovedveileder:
Ørjan Samuelsen

Forskningsprosjekter

Nedsatt følsomhet for ampicillin hos Haemophilus influenzae - mekanismer, påvisning og moleklær epidemiologi

Dagfinn Skaare, Nasjonal institusjon

Prosjektperiode:
2008 - 2013
Deltakende helseregion:
HSØ HN
Toksin-antitoksin systemer som stabiliserer resistensplasmider

Torunn Pedersen og Arnfinn Sundsfjord, UNN

Prosjektperiode:
2007 - 2013
Deltakende helseregion:
HN
Investigation of treatment options for infections caused by multidrug-resistent beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae

Ørjan Samuelsen og Arnfinn Sundsfjord, UNN

Prosjektperiode:
2011 - 2015
Deltakende helseregion:
HN
Multiresistent Klebsiella pneumoniae hos nyfødte

Arnfinn Sundsfjord og Knut Øymar, Nasjonal institusjon

Prosjektperiode:
2009 - 2013
Deltakende helseregion:
HV HN
Extended spectrum betalactamases - carriage, environmental dissemination and population epidemiology

Pål Jenum, Nasjonal institusjon

Prosjektperiode:
2009 - 2013
Deltakende helseregion:
HSØ HN
Påvisning av og mekanismer for nedsatt følsomhet for oxyimino-cefalosporiner hos Enterobacteriaceae

Arnfinn Sundsfjord og Ørjan Samuelsen, UNN

Prosjektperiode:
2007 - 2013
Deltakende helseregion:
HV HSØ HN
Hemming av bakteriers genuttrykk som antimikrobiall strategi

Kristin Hegstad og Eirik W Lundblad, UNN

Prosjektperiode:
2005 - 2012
Deltakende helseregion:
HN
Persistence and spread of vancomycin resistance determinants in Enterococcus faecium in Scandinavia

Kristin Hegstad og Torunn Pedersen, UNN

Prosjektperiode:
2006 - 2013
Deltakende helseregion:
HN
The Tromsø Skin and Staph Study (TSSS)

Johanna E Sollid og Anne Sofie Furberg, Universitetet i Tromsø

Prosjektperiode:
2007 - 2013
Deltakende helseregion:
HN
Strukturoppklaring av metallobetalaktamser og utvikling av inhibitorer

Ørjan Samuelsen, UNN

Prosjektperiode:
2007 - 2014
Deltakende helseregion:
HN
Forankring

Rapporten er forelagt ledelsen ved Universitetssykehuset Nord-Norge HF, ved Avdelingssjef Gunnar Skov Simonsen

Referansegruppen har i 2011 bestått av:
Dag Harald Skutlaberg
Helse Vest RHF
Dagfinn Skaare
Helse Sør-Øst RHF
Gunnar Skov Simonsen
Helse Nord RHF
Martin Steinbakk
Annen tilhørighet
Tone Tønjum
Annen tilhørighet
Trond Jakobsen
Helse Midt-Norge RHF
Ørjan Olsvik
Annen tilhørighet

eRapport er utarbeidet av Sølvi Lerfald og Reidar Thorstensen, Regionalt kompetansesenter for klinisk forskning, Helse Vest RHF, og videreutvikles av de fire RHF-ene i fellesskap, med støtte fra Helse Vest IKT

Alle henvendelser rettes til eRapport, Helse Nord

Personvern  -  Informasjonskapsler